药店质量负责人一般不能同时担任两家店的质量负责人。以下从不同角度对此问题进行分析：

法律法规角度

根据《药品经营质量管理规范》（GSP）的相关规定，药品经营企业的质量负责人应当具有药学中专或者医学、生物、化学等相关专业大学专科以上学历或者具有药学初级以上专业技术职称，并负责企业质量管理工作，确保药品质量。虽然该规范并未直接规定质量负责人不能同时担任两家店的质量负责人，但从实际操作和监管要求来看，一个质量负责人同时负责两家药店的质量管理，可能会因精力分散而无法有效履行其职责，从而违反GSP中关于质量负责人应专职负责、确保药品质量的要求。

实际操作与监管角度

1. 精力分配问题：质量负责人需要对企业药品的采购、验收、储存、养护、销售、退货等各个环节进行质量管理，确保药品质量。如果同时担任两家店的质量负责人，可能会因精力有限而无法对每家店都进行充分的管理和监督。
2. 责任划分问题：在药品经营过程中，如果发生质量问题，质量负责人需要承担相应的责任。如果质量负责人同时负责两家店，一旦其中一家店出现问题，可能会引发对另一家店质量管理的质疑，甚至导致责任划分不清。
3. 监管要求：药品监管部门在对药店进行日常监管时，会检查质量负责人的资质和履职情况。如果发现质量负责人同时担任多家店的质量负责人，可能会认为其无法有效履行职责，从而对药店进行处罚。

行业惯例与最佳实践

在药品经营行业中，为了确保药品质量和管理效果，通常建议每家药店都配备专职的质量负责人。这样不仅可以确保质量负责人有足够的精力和时间来履行其职责，还可以避免因责任划分不清而引发的管理问题。

建议：

• 药店在聘请质量负责人时，应确保其能够专职负责本店的质量管理工作。
• 如果确实需要质量负责人同时负责多家店（这种情况极为罕见且需特殊审批），应确保其有足够的精力和能力来履行职责，并明确责任划分和监管要求。
• 药店应遵守相关法律法规和监管要求，确保药品质量和管理效果。

如有任何关于药品经营质量管理方面的法律问题，可以直接向我咨询。