针对您提出的“排水工程导致损失怎么赔偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，排水设施作为城市基础设施的重要组成部分，受到法律法规的严格保护。任何单位和个人都不得从事危及排水与污水处理设施安全的活动，否则将承担相应的法律责任。

当排水工程因施工不当或其他原因导致损失时，赔偿问题主要依据以下几个方面来处理：

1. 行政处罚与追偿：

   • 如果破坏排水设施的行为被查实，相关部门（如市水务局）将依法对责任方进行行政处罚。
   • 同时，如果破坏行为导致了污水溢流等生态环境损害，责任方还需承担生态环境损害赔偿金。例如，在您提供的参考信息中，长沙某公司就因破坏排水设施导致污水溢流，被追偿了约96万元的生态环境损害赔偿金。

2. 赔偿责任：

   • 除了行政处罚和生态环境损害赔偿外，如果排水工程导致的损失涉及到了其他民事权益（如财产损失、人身伤害等），责任方还需依法承担相应的民事赔偿责任。
   • 赔偿范围通常包括直接损失（如修复费用、财产损失等）和间接损失（如因排水不畅导致的生产中断、营业损失等）。

3. 法律途径：

   • 如果责任方拒绝承担赔偿责任，受损方可以通过法律途径来维护自己的权益。这包括向法院提起民事诉讼，要求责任方赔偿损失。
   • 在诉讼过程中，法院将根据事实证据和法律规定，判断责任方的赔偿责任和赔偿范围。

4. 预防与监管：

   • 为了避免排水工程导致的损失，相关部门应加强对排水设施的保护和监管，确保施工活动符合法律法规和安全标准。
   • 同时，公众也应积极参与到排水设施的保护中来，监督和举报破坏排水设施的行为。

综上所述，当排水工程导致损失时，责任方需依法承担行政处罚、生态环境损害赔偿以及可能的民事赔偿责任。受损方可以通过法律途径来维护自己的权益。为了预防此类事件的发生，相关部门和公众应共同努力，加强对排水设施的保护和监管。