针对您提出的“没有结婚证有两个孩子一人带一个的协议怎么写”的问题，以下是一个详细的协议撰写指南，旨在帮助您清晰、准确地表达双方意愿，并保障孩子的合法权益。
协议标题
非婚生子女抚养及分居协议
协议双方信息
- 男方：姓名、身份证号、联系方式
- 女方：姓名、身份证号、联系方式
协议正文
一、总则
鉴于双方未办理结婚登记手续，但育有两个子女（子女姓名、出生日期），现因感情不合或其他原因，双方协商一致，决定分居并各自抚养一个子女。为明确双方权利与义务，特订立本协议。
二、子女抚养安排
子女分配：
- 子女A（姓名、出生日期）由男方抚养。
- 子女B（姓名、出生日期）由女方抚养。
抚养费支付：
- 双方同意，各自承担所抚养子女的全部生活费用、教育费用及医疗费用。
- 如遇特殊情况（如重大疾病、教育支出等），双方应协商分担，具体分担比例及方式另行约定。
探望权：
- 未直接抚养子女的一方享有探望权，具体探望时间、方式及频率由双方协商确定，并应确保不影响子女的正常生活和学习。
- 探望期间，未直接抚养子女的一方应负责子女的安全与健康，不得有损害子女身心健康的行为。
三、分居期间财产及债务处理
财产归属：
- 分居期间，双方各自取得的财产及收入归各自所有，不为共同财产。
- 双方原有的共同财产（如有），应在本协议签订前进行清算，并明确归属。
债务承担：
- 分居期间，各方产生的债务归各自承担，与另一方无关。
- 如因共同生活或子女抚养需要而产生的债务，应经双方协商一致后共同承担。
四、分居期限及终止
分居期限：
- 本协议分居期限为_年，自_年_月_日起至_年_月____日止。
- 分居期限届满前，双方可协商续签或终止本协议。
分居终止：
- 分居期间，如双方感情恢复或达成其他共识，可协商终止本协议，并签订终止分居的书面协议。
- 分居期限届满，如双方未续签本协议且未达成其他共识，则本协议自动终止。
五、其他约定
保密条款：
- 双方应对本协议内容及在分居期间获知的对方隐私信息予以保密，不得向第三方泄露。
争议解决：
- 如因本协议产生争议，双方应首先协商解决；协商不成的，可向有管辖权的人民法院提起诉讼。
协议结尾
- 双方签字：男方、女方应在协议末尾签字并注明签字日期。
- 见证人（可选）：如有需要，可邀请第三方作为见证人签字，以增强协议的法律效力。
注意事项
- 在撰写协议时，应确保内容真实、准确、完整，不得有隐瞒、欺诈或误导性陈述。
- 协议内容应符合法律法规的规定，不得违反公序良俗或损害第三方利益。
- 协议签订前，建议双方咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保协议的合法性和有效性。
希望以上指南能帮助您撰写一份清晰、准确、合法的非婚生子女抚养及分居协议。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时咨询专业律师。