当不同行政区域之间发生水事纠纷时，处理方式主要遵循《中华人民共和国水法》的相关规定，并可以结合地方性的具体实施办法。以下是对这一问题的详细解答：

一、协商处理

首先，不同行政区域之间发生水事纠纷时，应当首先通过协商的方式进行处理。协商是解决纠纷的最直接、最有效的方式，有助于各方在平等、自愿的基础上达成共识，维护良好的邻里关系和区域合作。

二、上一级人民政府裁决

如果协商不成，那么纠纷应提交给上一级人民政府进行裁决。上一级人民政府会根据相关法律法规和实际情况，对纠纷进行公正、合理的裁决。有关各方必须遵照执行这一裁决结果，以确保纠纷得到妥善解决。

三、临时处置措施

在水事纠纷解决前，为了防止纠纷进一步恶化或造成不可挽回的损失，县级以上人民政府或者其授权的部门有权采取临时处置措施。这些措施可能包括限制某些活动、保护现场证据等，以确保纠纷的公正处理。有关各方或者当事人必须服从这些临时处置措施。

四、禁止单方面改变现状

在水事纠纷解决前，未经各方达成协议或者共同的上一级人民政府批准，在行政区域交界线两侧一定范围内，任何一方不得修建排水、阻水、取水和截（蓄）水工程，也不得单方面改变水的现状。这一规定旨在防止纠纷双方通过单方面行动加剧矛盾，确保纠纷的公正、和平解决。

五、地方性实施办法

除了《中华人民共和国水法》的普遍规定外，不同地区还可能根据本地实际情况制定具体的实施办法。例如，某些地区可能设立了专门的行政裁决机构或调解机制来处理水事纠纷。这些地方性实施办法通常会在当地政府网站或相关政务服务平台上公布，供公众查询和参考。

六、实际案例与操作

以北京市房山区为例，该地区对于防汛抗洪水事纠纷的处理有明确的办事指南。这包括申请条件、办理流程、办理时间、办理地点等详细信息。自然人、企业法人、事业法人、社会组织法人以及其他组织在发生水事纠纷时，可以按照这些指南向相关部门申请调解或裁决。

综上所述，不同行政区域之间发生水事纠纷时，应首先通过协商处理；协商不成的，由上一级人民政府裁决；在水事纠纷解决前，应遵守临时处置措施和禁止单方面改变现状的规定；同时，可以参考地方性实施办法和实际案例来更好地理解和处理纠纷。