在商业贿赂案件中，违法所得的认定主要涉及行贿方和受贿方，具体认定方式如下：

一、行贿方违法所得的认定

行贿方用于行贿的所有财物都应被认定为非法所得。这包括但不限于现金、实物（如名表、珠宝等贵重物品）、有价证券等。行贿行为本身破坏了公平的竞争环境，因此行贿财物的性质也随之变为非法，行贿人自然不能继续保有这些财物。例如，若某公司为获取项目，向负责招标的人员行贿巨额现金及贵重物品，这些财物即应被认定为非法所得。

二、受贿方违法所得的认定

受贿方通过商业贿赂获得的财物、回扣、手续费等经济利益，都属于非法所得。这包括受贿人直接收受的贿赂款，以及利用职务便利为他人谋利后拿到的好处费等。例如，某公司负责人收受贿赂后，为行贿方提供交易机会或竞争优势，其收受的贿赂款及可能获得的好处费等，都应认定为非法所得。

三、违法所得认定的具体操作

1. 证据收集：在认定违法所得时，要全面收集相关证据，包括合同、发票、转账记录、证人证言等。这些证据有助于准确确定商业贿赂行为所涉及的非法获利数额。

2. 价值评估：对于实物类违法所得，如名表、珠宝等，需要进行价值评估，以确定其市场价值，进而作为非法所得的认定依据。

3. 追缴程序：一旦认定违法所得，相关部门会依法进行追缴，确保违法者不能从中获利。追缴程序通常包括通知违法者、查封扣押财物、拍卖变卖财物等步骤。

四、法律后果与防范建议

1. 法律后果：商业贿赂行为将面临严厉的法律制裁，包括刑事处罚和行政处罚。行贿方和受贿方均可能受到罚款、没收违法所得、吊销营业执照等处罚，相关责任人还可能承担刑事责任。

2. 防范建议：

   • 加强自律：企业和个人应建立健全的反贿赂制度，加强内部控制，提高法律意识和道德素养。
   • 加大监管力度：相关部门应加强对市场的监管，严厉打击商业贿赂行为。
   • 推动社会共治：鼓励社会各界参与商业贿赂的治理工作，形成全社会共同监督的良好氛围。

举例说明：假设某公司为获取某项目，向负责该项目招标的人员行贿现金100万元及名贵手表一块。后该商业贿赂行为被举报。在认定违法所得时，行贿方用于行贿的100万元现金及名贵手表应全部认定为非法所得；受贿方收受的贿赂款及可能因该项目获得的好处费等，也应认定为非法所得并依法追缴。

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