结论：一般情况下，按时偿还两万多元网贷对申请农村信用社贷款没有直接的负面影响，但可能存在间接影响，具体如下：

1. 信用记录方面：

   • 正面影响：按时偿还网贷表明您具有良好的信用意识和还款能力，这会在您的个人信用报告中留下积极的记录。农村信用社在审批贷款时，通常会查看申请人的信用报告，良好的信用记录有助于增加信用社对您的信任，提高贷款审批通过的可能性。
   • 负面影响：如果网贷平台在上传信用信息时出现错误，例如错误地记录了您的还款情况，导致信用报告显示您有逾期等不良记录，这将对申请农村信用社贷款产生负面影响。不过，这种情况相对较少，一旦发现信用报告有误，您可以及时向相关机构提出异议申请，要求更正。

2. 负债情况方面：

   • 无显著影响：两万多元的网贷负债，如果您的收入水平较高，且整体负债在合理范围内，不会对您的还款能力造成太大压力，农村信用社在评估您的贷款申请时，可能不会因为这笔网贷而拒绝您的贷款。
   • 潜在影响：如果您的收入水平一般，加上这笔网贷负债后，您的负债收入比（即每月债务还款额与每月收入的比例）过高，农村信用社可能会认为您的还款能力不足，从而影响贷款审批。例如，假设您每月收入为5000元，而每月需要偿还网贷和其他债务共计4000元，负债收入比达到了80%，这种情况下信用社可能会谨慎考虑是否批准您的贷款申请。

3. 贷款用途和综合评估方面：

   • 贷款用途合规则无影响：农村信用社在审批贷款时，会关注贷款的用途。如果您的贷款用途符合信用社的规定，例如用于农业生产、农村消费等合法合规的用途，且您按时偿还网贷的情况能够证明您具有良好的信用和还款意愿，一般不会因为有两万多元的网贷而影响贷款。
   • 综合评估不过关可能有影响：农村信用社在审批贷款时会进行综合评估，除了信用记录和负债情况外，还会考虑您的职业稳定性、家庭状况等因素。如果您的综合评估结果不理想，即使按时偿还了网贷，也可能影响贷款的审批。例如，您的工作不稳定，经常更换工作，或者家庭负担较重，这些因素都可能使信用社对您的还款能力产生疑虑。

建议：在申请农村信用社贷款前，您可以先查询自己的信用报告，确保信用记录准确无误。同时，合理规划自己的负债，保持适当的负债收入比。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。