占用农村集体所有的土地中商业服务类设施用地，是否需要支付占用使用费，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、土地管理法规角度
根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，农村集体所有的土地由农村集体经济组织或者村民委员会经营、管理。对于占用农村集体土地进行非农业建设（包括商业服务类设施用地）的行为，法律上有严格的规定。
合法占用：如果占用行为经过了合法的审批程序，如取得了土地使用权证或相关建设用地批准文件，并且按照规定的用途和期限使用土地，那么通常不需要额外支付“占用使用费”，但可能需要按照土地出让合同或相关规定缴纳土地出让金等费用。
非法占用：如果未经合法审批，擅自占用农村集体土地进行商业服务类设施建设，则属于违法行为。在此情况下，不仅可能需要支付占用使用费（作为对非法占用行为的补偿），还可能面临行政处罚，如责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状，以及罚款等。
二、合同或协议约定角度
在实际操作中，农村集体经济组织或村民委员会可能会与占用方签订土地使用合同或协议，明确双方的权利和义务，包括是否需要支付占用使用费、支付标准、支付方式等。
有约定：如果合同或协议中明确约定了占用方需要支付占用使用费，那么占用方应当按照约定履行支付义务。
无约定：如果合同或协议中没有明确约定，则需要根据相关法律法规和实际情况进行判断。在此情况下，如果占用行为未经合法审批，则更可能被视为需要支付占用使用费。
三、实际操作建议
合法审批：在占用农村集体土地进行商业服务类设施建设前，务必确保已经取得了合法的审批手续，以避免非法占用的法律风险。
明确约定：如果与农村集体经济组织或村民委员会签订土地使用合同或协议，应当明确约定是否需要支付占用使用费以及支付的具体标准、方式等，以避免后续纠纷。
咨询专业意见：由于土地法律问题具有复杂性和地域性，建议在具体操作前咨询当地土地管理部门或专业律师的意见，以确保合法合规。
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