当申请人决定撤回执行申请，并且案件已经终结时，法院的处理方式通常遵循以下步骤和原则，我将为您详细阐述：

一、法院作出准予撤回的裁定

一旦您决定撤回执行申请，法院会对此进行审查。若您的撤回申请符合法律规定，法院会作出准予撤回的裁定。这一裁定标志着当前的执行程序暂时告一段落，即执行程序被暂停。

二、停止正在进行的执行措施

在作出准予撤回的裁定后，法院会立即停止所有正在进行的执行措施。这包括但不限于：

1. 停止查封：原本对被执行人财产所采取的查封措施会停止，被查封的财产将不再受法院的控制。
2. 停止扣押：被扣押的财产会暂停扣押状态，被执行人可以重新获得对财产的控制权。
3. 解除冻结：对冻结的资金或其他财产的冻结状态会解除，被执行人可以自由使用这些资金或财产。
4. 终止拍卖等执行行为：原本计划进行的拍卖等执行行为也会就此终止，不再进行。

三、归档保管案件卷宗材料

与此同时，法院会把与该案件相关的所有卷宗材料进行归档保管。这些材料包括但不限于执行申请书、裁定书、执行过程中的相关证据和记录等。归档保管意味着这些材料将被妥善保存，以备后续需要时查阅。

四、再次申请执行的可能性

虽然您已经撤回了执行申请，但并不意味着您永远失去了通过法律手段维护自己权益的机会。如果您之后发现了新的财产线索，或者有其他合理的原因需要再次申请执行，只要还在法定的申请执行时效期间内，您就可以再次向法院提出执行申请。法院会重新对案件进行审查，一旦符合条件，就会再次启动执行程序，继续为您的权益而努力。

五、注意事项

1. 时效性：再次申请执行时，必须确保在法定的申请执行时效期间内提出。否则，法院可能会拒绝受理您的申请。
2. 新证据或线索：再次申请执行时，最好能提供新的财产线索或其他合理的原因，以增加法院准予执行的可能性。
3. 法律程序：再次申请执行时，需要遵循法律规定的程序和要求，如提交执行申请书、提供相关证据等。

综上所述，当申请人撤回执行申请且案件已经终结时，法院会作出准予撤回的裁定，停止正在进行的执行措施，归档保管案件卷宗材料，并允许在符合条件下再次申请执行。希望这些信息能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律建议，请随时咨询。