法院判令掩饰隐瞒犯罪案件中的被告人退赔全部涉案金额，在多数情况下是合理的，但需结合具体案情判断。以下从不同角度进行分析：
一、退赔全部涉案金额的合理性基础
法律义务：根据《中华人民共和国刑法》第三百一十二条及相关司法解释，掩饰、隐瞒犯罪所得、犯罪所得收益罪的行为人，有义务退赔与自身犯罪行为直接相关的涉案资金或财物。若无法明确区分实际掩饰、隐瞒的具体金额，通常需对全部涉案金额负责退赔。这是法律对犯罪行为人的一种惩罚性措施，旨在恢复被犯罪行为破坏的社会秩序和被害人权益。
悔罪态度体现：全部退赔能体现行为人的悔罪态度，是法院量刑时的重要参考。法院在量刑时会综合考虑犯罪性质、退赔行为对损害结果的弥补程度等因素，来确定从宽的幅度。全部退赔通常意味着行为人对自己的犯罪行为有了深刻的认识，并愿意积极弥补损失，因此法院在量刑时可能会给予一定的从轻处罚。
司法公正与被害人权益保障：要求退赔全部涉案金额，有助于司法机关对整个犯罪链条进行更完整的考量，保证罪责和刑罚相适应，维护司法公正和法律的严肃性。同时，这也是对被害人权益的一种保障，能够尽量减少被害人的损失。
二、可能存在的例外情况
能明确区分实际涉案金额：若行为人能提供证据证明自己仅对部分金额实施了掩饰、隐瞒行为，那么退赔范围应限于该部分金额。例如，在共同犯罪中，如果行为人能够证明自己只参与了部分犯罪所得的掩饰、隐瞒，那么法院在判决时可能会只要求其退赔该部分金额。
退赔能力限制：虽然法律要求退赔全部涉案金额，但行为人的退赔能力也是一个需要考虑的因素。如果行为人确实没有能力退赔全部金额，法院可能会根据其实际情况，酌情确定退赔金额。然而，这并不意味着行为人可以完全免除退赔义务，而是在能力范围内尽可能退赔。
三、法律建议
积极配合退赔：对于涉嫌掩饰、隐瞒犯罪所得、犯罪所得收益罪的行为人来说，积极配合退赔是争取从宽处理的重要途径。通过退赔，可以体现自己的悔罪态度，减少法院在量刑时的负面评价。
提供证据证明退赔范围：如果行为人认为自己只应对部分金额负责退赔，那么应积极提供证据证明自己的主张。这可以包括交易记录、证人证言等，以证明自己实际参与的掩饰、隐瞒行为的具体金额。
咨询专业律师：在面对此类法律问题时，行为人应咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据案件的具体情况，为行为人提供针对性的法律策略和辩护意见。
案例分析：
假设某案件中，行为人因涉嫌掩饰、隐瞒犯罪所得被警方调查。经查明，行为人帮助他人掩饰的犯罪所得金额为100万元。在案件处理过程中，行为人及其家属对于退赔金额产生争议。如果行为人无法提供证据证明自己只对部分金额实施了掩饰、隐瞒行为，那么法院可能会判令其退赔全部100万元涉案金额。然而，如果行为人能够提供充分的证据证明自己只参与了其中50万元的掩饰、隐瞒行为，那么法院在判决时可能会只要求其退赔这50万元。
综上所述，法院判令掩饰隐瞒犯罪案件中的被告人退赔全部涉案金额在多数情况下是合理的，但需结合具体案情判断。行为人应积极配合退赔，并在必要时提供证据证明自己的退赔范围。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。