员工一般不可以仅通过“不申请”的方式自愿放弃休假，除非以书面形式明确提出不休年休假。以下是对此问题的详细分析：

一、法律对年休假的规定

根据《职工带薪年休假条例》第五条第一款：“单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。”以及《企业职工带薪年休假实施办法》第十条第二款：“用人单位安排职工休年休假，但是职工因本人原因且书面提出不休年休假的，用人单位可以只支付其正常工作期间的工资收入。”从这些规定可以看出，安排年休假是用人单位必须履行的法定义务，即使劳动者未主动提出申请，用人单位也有责任主动安排。

二、员工自愿放弃休假的条件

1. 书面形式：员工若想自愿放弃年休假，必须以书面形式明确提出。这是法律规定的必要条件，也是确保员工真实意愿得到体现的重要方式。
2. 真实意愿：员工放弃年休假必须是出于其真实意愿，未受到任何外部压力或不当影响。如果员工是在被胁迫或误导的情况下放弃年休假，那么这种放弃行为是无效的。

三、公司规定与法律冲突的处理

如果公司制定的规定与法律相抵触，例如“员工未提出休年休假申请即视同放弃休假权”，那么这种规定是无效的。因为法律具有更高的效力，公司规定不能违反法律的规定。在这种情况下，公司仍然需要支付员工未休年休假的工资报酬。

四、实际操作中的建议

1. 员工方面：

   • 如果确实需要放弃年休假，建议以书面形式向公司提出申请，并明确说明放弃的原因和自愿性。
   • 保留好相关证据，如申请书、公司批准文件等，以备不时之需。

2. 公司方面：

   • 在制定相关规章制度时，应确保与法律相符，避免与法律相抵触的条款。
   • 在接受员工放弃年休假的申请时，应与员工进行充分沟通，确保员工是在充分了解自己权益的基础上做出自愿放弃的决定。
   • 严格审查申请书的真实性和合法性，并在批准后妥善保留相关申请材料。

举例说明：假设某员工因个人原因想放弃当年的年休假，他应该向公司提交一份书面申请，明确说明放弃的原因和自愿性。公司收到申请后，应与员工进行沟通，确认员工的真实意愿，并在批准后保留好相关申请材料。如果员工没有以书面形式提出放弃申请，或者公司没有与员工进行充分沟通就擅自认为员工放弃了年休假，那么这种做法是违法的，公司仍然需要支付员工未休年休假的工资报酬。

综上所述，员工不可以仅通过“不申请”的方式自愿放弃休假。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。