关于员工委托代理人去医院开证明是否有效的问题，这主要取决于医院开具证明的具体流程和规定，以及相关法律法规的要求。

首先，从法律法规的角度来看，医师法和医疗机构管理条例都明确规定了医师在签署医学证明文件时，必须亲自诊查、调查，并按照规定及时填写病历等医学文书。这意味着，如果医生没有亲自对病人进行诊查，而是根据他人的描述或请求来开具证明，那么这种证明可能是无效的，甚至医生可能会因此受到行政处罚。

具体来说，医师法规定，医师不得出具虚假医学证明文件，以及与自己执业范围无关或者与执业类别不相符的医学证明文件。对于未经亲自诊查、调查就签署证明文件的行为，卫生健康主管部门会责令改正，并可能给予警告、没收违法所得、罚款等处罚，情节严重的还可能暂停执业活动直至吊销医师执业证书。

同时，医疗机构管理条例也明确规定，未经医师亲自诊查病人，医疗机构不得出具疾病诊断书、健康证明书等证明文件。违反规定出具虚假证明文件的，卫生行政部门会予以警告，对造成危害后果的，还可以处以罚款。

此外，国家卫生健康委办公厅关于进一步加强医学证明文件类医疗文书管理工作的通知也强调了医疗机构应当规范医师开具医疗文书的行为，不得向未在本机构就诊的人员开具医疗文书，不得出具虚假医疗文书。

因此，如果员工委托代理人去医院开证明，而医生并未亲自对员工进行诊查，那么这种证明很可能是无效的，并且医生和医院都可能因此受到相应的处罚。为了确保证明的有效性，建议员工亲自前往医院就诊，并由医生根据其实际病情开具相应的证明文件。