可以澄清投标人证书是公司曾用名的情况。在招投标过程中，如果投标人证书上使用的是公司的曾用名，而当前公司名称已经发生变更，那么投标人有必要进行澄清，以确保投标文件的准确性和合规性。

1. 澄清的必要性：

   • 避免误解：使用曾用名可能会导致招标方或评标委员会对投标人的身份产生误解，影响投标文件的评审。
   • 合规要求：根据招投标相关法律法规，投标人应提供真实、准确、完整的投标文件。如果公司名称已经变更，而投标文件仍使用曾用名，可能构成虚假陈述或隐瞒事实，违反合规要求。

2. 澄清的方式：

   • 提交证明文件：投标人可以向招标方提交公司名称变更的证明文件，如工商变更登记证明、营业执照等，以证明当前公司名称与投标人证书上使用的曾用名之间的关系。
   • 书面澄清说明：投标人还可以撰写书面澄清说明，详细解释公司名称变更的情况，并明确说明投标人证书上使用的曾用名与当前公司名称的对应关系。

3. 澄清的时机：

   • 投标前澄清：在提交投标文件前，投标人应主动与招标方沟通，就公司名称变更的情况进行澄清，并确保投标文件中使用的是正确的公司名称。
   • 评标过程中澄清：如果投标文件已经提交，但在评标过程中发现公司名称问题，投标人应及时向招标方或评标委员会提交澄清说明和证明文件，以避免因公司名称问题导致投标无效。

4. 法律后果：

   • 如果投标人未及时澄清公司名称变更的情况，可能会导致投标文件被认定为无效，从而失去参与招投标的资格。
   • 在某些情况下，如果投标人故意隐瞒公司名称变更的事实，还可能构成欺诈行为，需要承担相应的法律责任。

综上所述，投标人证书是公司曾用名的情况是可以澄清的，并且有必要进行澄清以确保投标文件的准确性和合规性。如果您在招投标过程中遇到类似问题，建议及时与招标方沟通并寻求专业法律意见。