破产案件中债权抵消申请书与债权抵消债务通知书的区别主要在于法律性质、提交主体、提交时间、内容要求及法律效果五个方面，以下为您详细阐述：

1. 法律性质：

   • 债权抵消申请书：在破产程序中，当债权人希望以其对债务人享有的债权与其对债务人负有的债务进行抵消时，需向破产管理人提交债权抵消申请书。这是一种请求权，旨在获得破产管理人的认可，从而实现债权的抵消。
   • 债权抵消债务通知书：则是在双方互负债务的情况下，一方通知对方以其债权抵消其债务的行为。在破产程序外，这通常是一种单方面的法律行为，一旦通知到达对方，即产生抵消的法律效果。但在破产程序中，由于涉及多方利益，其效力可能受到破产法的特别规定限制。

2. 提交主体：

   • 债权抵消申请书：由希望进行债权抵消的债权人提交给破产管理人。
   • 债权抵消债务通知书：在破产程序外，可由任何一方互负债务的主体发出；但在破产程序中，若债权人希望以其债权抵消债务，仍需通过破产管理人进行，此时虽形式上可能为“通知”，但实质上仍需遵循破产程序的规则，且往往需要以申请书的形式提出并附相关证据，而非简单的通知书。不过，若从广义上理解“通知书”为传达抵消意愿的书面文件，则其提交主体在破产程序外为任意互负债务方，在破产程序内理论上仍为债权人，但操作上需通过破产管理人。

3. 提交时间：

   • 债权抵消申请书：需在破产程序进行中，且通常在破产管理人要求债权人申报债权后的一定期限内提交。
   • 债权抵消债务通知书：在破产程序外，可在任何双方互负债务且均到期的情况下发出；在破产程序内，则需遵循破产法的特别规定，如需在破产管理人指定的期限内提出，并可能需经过破产管理人的审核。

4. 内容要求：

   • 债权抵消申请书：需详细列明申请人的债权情况、债务情况、抵消的金额及理由等，并附相关证据材料。
   • 债权抵消债务通知书：在破产程序外，通常只需简要说明抵消的债权债务情况；在破产程序内，则可能需包含与申请书相似的内容，并附相关证据，以供破产管理人审核。

5. 法律效果：

   • 债权抵消申请书：需经破产管理人审核认可后，方可产生抵消的法律效果。若破产管理人认为不符合抵消条件，则可能驳回申请。
   • 债权抵消债务通知书：在破产程序外，一旦通知到达对方，即产生抵消的法律效果；在破产程序内，其效力可能受到破产法的限制，如需经过破产管理人的审核或法院的裁定等。

建议：在破产案件中，若您希望进行债权抵消，建议首先咨询专业律师，了解具体的法律程序和要求，并准备相应的债权抵消申请书及相关证据材料。同时，注意遵守破产管理人指定的期限和程序，以确保您的权益得到妥善保护。若您在破产案件债权抵消方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。