企业申请注销后，其法人资格将依法终止，且必须经过法定清算程序，这一过程对公司及其股东、债权人等利益相关方均会产生重要影响。以下是对企业申请注销法律后果的详细分析：

一、法人资格及诉讼主体资格的消灭

1. 法人资格终止：企业一旦完成注销登记，其法人资格即告终止，意味着企业作为独立的法律实体不再存在。因此，企业无法再以自身名义从事任何民事活动，包括签订合同、开展业务以及参与诉讼等。
2. 诉讼主体资格丧失：注销后，企业丧失诉讼主体资格，无法行使诉讼权利或履行诉讼义务。若企业在注销前有尚未审结的诉讼，一般会因主体资格消灭而终结，但也可能存在特殊的清算责任等相关后续处理情况。

二、债权债务的全面清理

1. 清算程序：企业在注销前必须依法进行清算，这是注销过程中的核心环节。清算组需对企业的财产进行全面清理，编制资产负债表和财产清单，并通知、公告债权人进行债权申报。
2. 债务清偿：若企业财产足以清偿债务，则按法定顺序偿还各类债务，如职工工资、社会保险费用、税款以及普通债务等。完成清偿后，剩余财产按股东的出资比例或公司章程规定进行分配。
3. 破产申请：若企业财产不足以清偿债务，则需依法向人民法院申请宣告破产。未了结的债权债务由清算主体承担相应责任。同时，如果清算程序存在违法违规行为，相关清算责任主体可能仍需对企业债务承担相应责任。

三、股东责任的终止与特殊情况

1. 责任终止：一般情况下，企业注销后，股东对企业的责任也随之终止。
2. 特殊情况：然而，在特定情况下，如股东在企业存续期间存在违法行为或未依法履行清算义务，导致企业财产被非法侵占或债权人利益受损，股东仍需承担相应的赔偿责任。此外，如果清算程序存在违法违规行为，股东等责任主体也可能面临行政或刑事处罚。

四、合同关系的变更或终止

1. 合同履行变化：企业注销前签订的合同，由于企业主体资格的消灭，其履行情况会发生变化。根据合同的性质和约定，可能出现合同目的无法实现而自然终止、由权利义务承继者继续履行或在符合法律规定和合同约定的情况下由清算组决定是否继续履行等情况。
2. 违约责任：若决定不履行合同，则可能产生违约责任等相关问题。因此，企业在注销前应对合同进行妥善处理，以避免不必要的法律纠纷。

五、知识产权的妥善处理

1. 知识产权失效风险：企业拥有的知识产权，如商标、专利、著作权等，在企业注销后需要进行妥善处理。如果在注销前没有进行转让、许可使用等安排，可能会面临失效或被相关部门依法注销等风险。
2. 合理处置建议：因此，建议企业在注销前对知识产权进行合理处置，如转让给其他企业或个人、进行许可使用等，以避免权利的丧失。

六、员工劳动关系的解除与安置

1. 劳动合同终止：企业注销意味着其经营活动的终结，与员工的劳动关系也随之解除。企业应当按照法律规定，在注销前对员工进行妥善安置，支付员工工资、经济补偿金等相关费用。
2. 社保和公积金处理：企业需办理员工社保和公积金账户的减员及账户注销手续，确保员工权益的连续性。员工也应及时办理转移或接续手续，避免影响自身待遇。

七、档案保存与商业信誉影响

1. 档案保存：企业注销的相关档案需由登记机关依法保存一定期限，以备后续查询和处理相关事宜。
2. 商业信誉影响：同时，企业注销可能对其商业信誉产生一定影响，降低合作伙伴、客户等的信任度。因此，企业在注销前应充分考虑这些因素，并采取相应的措施以减轻潜在的不利影响。

建议：为确保企业注销的顺利进行并降低法律风险，建议企业在注销前咨询专业律师，如我本人，并严格按照相关法律法规进行操作。如果在注销过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询。