核心结论：股东实缴注资发函过期后，可采取协商、催告、法律诉讼等措施来处理，具体需结合实际情况选择合适方式。以下是详细分析：

1. 协商解决：

   • 前提：在发函过期后，首先可以尝试与股东进行友好协商，了解其未按时实缴注资的原因。
   • 操作：通过书面或口头形式，向股东明确表达公司对其未按时实缴的关切，并询问其是否有意继续履行出资义务。若股东表示愿意出资但遇到困难，可协商延期出资或分期出资等方案。
   • 优势：协商解决成本较低，有助于维护股东与公司之间的良好关系。

2. 催告出资：

   • 前提：若协商无果，公司可向未按时实缴的股东发出正式的催告函。
   • 操作：催告函中应明确股东的出资义务、未按时出资的违约责任以及公司要求其限期出资的具体要求。同时，可附上相关法律法规条款，以增强催告的权威性。
   • 优势：催告函具有正式性和法律效力，能够促使股东重视出资义务，并可能促使其尽快出资。

3. 法律诉讼：

   • 前提：若催告后股东仍未履行出资义务，公司可考虑通过法律途径解决。
   • 操作：向法院提起诉讼，要求股东履行出资义务并承担违约责任。在诉讼过程中，公司需提供充分的证据证明股东未按时实缴注资的事实以及因此给公司造成的损失。
   • 优势：法律诉讼具有强制执行力，能够确保股东履行出资义务，并可能获得相应的赔偿。但需注意，诉讼过程可能较长且成本较高。

4. 调整公司资本结构：

   • 前提：在股东长期无法履行出资义务的情况下，公司可考虑调整资本结构。
   • 操作：通过减少注册资本、引入新股东或进行股权转让等方式，调整公司的资本构成，以降低对未实缴股东的依赖。
   • 优势：调整公司资本结构有助于优化公司的财务状况，提高公司的抗风险能力。但需注意，调整资本结构需遵循相关法律法规，并可能涉及复杂的法律程序。

特别提醒：在处理股东实缴注资发函过期的问题时，公司应确保所有操作均符合相关法律法规的要求，避免因操作不当而引发法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。