签名被涂抹后仍然可以进行笔迹鉴定。笔迹鉴定是根据人的书写技能习惯特征，在书写的字迹与绘画中的反映来鉴别书写人的专门技术。以下是对此问题的详细分析：

一. 笔迹鉴定的基本原理

笔迹鉴定不仅能检验正常笔迹，还能检验包括书写条件（如书写工具、衬垫物等）变化笔迹、故意伪装笔迹（如左手笔迹、摹仿笔迹和绘画笔迹）在内的多种情况。即使签名被涂抹，只要涂抹没有彻底破坏原有的笔迹特征，仍然有可能通过技术手段进行鉴定。

二. 签名被涂抹后的鉴定方法

1. 直接观察法：利用各种不同的光源如自然光、紫外光、蓝光灯、红外鉴别仪等单一光源直接观察或用放大镜观察。红外线检验是利用红外线的透射能力强于可见光和紫外线，当掩盖物质透过红外而被掩盖文字吸收红外线的情况下，可显现出被掩盖的字迹。

2. 显现被掩盖字迹的特定方法：如分色照相、荧光照相、涂层物质分离法（包括机械法除去表面涂层、激光方法蒸发表面涂层物质、化学试剂溶解法除去表面涂层）、静电压痕显示仪法、867显示剂法等。这些方法可以根据被涂抹掩盖字迹的具体情况选择合适的一种或多种进行使用。

三. 笔迹鉴定的法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第八十条，鉴定人有权了解进行鉴定所需要的案件材料，并应提出书面鉴定意见。这意味着在司法程序中，笔迹鉴定是被法律所认可的，并可以作为证据使用。

四. 签名被涂抹后的法律效力

签名被涂抹后是否有效，取决于涂掉签字的具体情况和背后的意图。如果涂改内容是双方的真实意思表示，并且双方都没有异议，那么涂改的合同仍然具有法律效力。然而，如果涂改是出于欺诈、误导等不正当目的，那么这样的行为可能是违法的，不仅签字无效，行为人还可能承担相应的法律责任。

综上所述，签名被涂抹后仍然可以进行笔迹鉴定。在实际操作中，应选择专业的鉴定机构进行鉴定，并提供充分的样本材料以确保鉴定结果的准确性和可靠性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。