夫妻双方有协议的情况下，该协议能否申请强制执行，取决于协议本身的合法性、有效性以及是否经过公证等多方面因素。以下是对这一问题的详细分析：
协议合法有效：
- 协议内容必须符合法律规定，不能违背法律的强制性规定，例如不能约定逃避债务、损害国家或他人利益等行为。
- 协议也不能违反公序良俗，比如不能约定以违背道德伦理的方式处置财产。
- 如果协议内容存在损害第三人利益等违反法律强制性规定或违背公序良俗的情形，该协议将无法被强制执行。
经过公证程序：
- 公证能增强协议的公信力和执行力。经过公证的协议，其真实性和合法性得到了公证机构的确认。
- 在一方不履行协议约定时，另一方可以向法院申请强制执行。但需要注意的是，即使协议经过公证，如果协议内容本身违法或违背公序良俗，仍然无法被强制执行。
未经过公证但合法有效的协议：
- 如果协议未经公证，但内容合法有效，且没有违反法律强制性规定或违背公序良俗，那么在一方不履行协议时，另一方虽然不能直接向法院申请强制执行，但可以通过法律途径（如起诉）来要求对方履行协议。
- 法院在审理此类案件时，会审查协议的合法性和有效性，并据此作出判决。如果判决支持原告的诉求，被告仍不履行，原告可以申请法院强制执行判决。
举例说明：
假设小朱和小丽是夫妻，二人签订了一份夫妻财产协议，约定将大部分财产归小朱所有。如果这份协议内容合法有效，且经过了公证，那么在小丽反悔拒绝按协议执行时，小朱就可以向法院申请强制执行。但如果这份协议未经公证，或者协议内容存在违法或违背公序良俗的情况，那么小朱就无法直接向法院申请强制执行，而需要通过法律途径来解决争议。
建议：
- 在签订夫妻财产协议时，务必确保协议内容合法有效，不违反法律强制性规定和公序良俗。
- 考虑将协议进行公证，以增强其公信力和执行力。
- 如果遇到对方不履行协议的情况，及时咨询专业律师，通过法律途径来维护自己的合法权益。
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