结论前置：针对您提出的“刑事案件怀孕在检察院办监视居住两个月了还没好”的问题，这可能涉及监视居住期限、程序合法性以及后续处理等多个方面。以下是我从不同角度为您进行的分析和建议。
一、监视居住的期限与合法性
监视居住的期限：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，监视居住的期限最长不得超过六个月。您目前处于监视居住状态已两个月，仍在合法期限内。但若超过六个月仍未解除或变更强制措施，则可能涉及程序违法。
程序合法性：
- 检察院在办理刑事案件时，若对犯罪嫌疑人采取监视居住措施，必须严格遵守法定程序。这包括有证据证明有犯罪事实、可能判处徒刑以上刑罚、采取取保候审不足以防止社会危险性等条件。
- 若您认为监视居住的程序存在违法，如未依法通知家属、未在规定时间内执行等，您可以向检察院或上级检察机关提出申诉，要求纠正违法行为。
二、监视居住期间的权利与义务
您的权利：
- 在监视居住期间，您仍享有基本的公民权利，如人身自由不受非法限制（但需在指定居所内活动）、通信自由（但可能受到一定限制）、获得法律帮助等。
- 您有权要求检察院或执行机关说明监视居住的理由和依据，并有权对监视居住的决定提出异议。
您的义务：
- 您需遵守监视居住的规定，如不得离开指定的居所、不得与特定的人员会见或通信、不得干扰证人作证等。
- 若您违反监视居住的规定，可能会面临被逮捕或更严厉的强制措施。
三、后续处理与建议
了解案件进展：
- 您可以主动向检察院或您的辩护律师了解案件的进展情况，包括是否已提起公诉、证据收集情况等。
- 若案件已进入审查起诉阶段，您可以关注检察院是否已向法院提起公诉，以及公诉的具体内容和请求。
准备辩护：
- 若您已被指控犯罪，建议您尽早委托辩护律师，为您进行辩护准备。辩护律师可以帮您分析案情、收集证据、提出辩护意见等。
- 在辩护过程中，您可以与辩护律师充分沟通，表达您的意见和诉求，共同制定辩护策略。
关注监视居住的变更或解除：
- 若在监视居住期间，案件情况发生变化，如证据不足、犯罪情节轻微等，检察院可能会考虑变更或解除监视居住措施。
- 您可以关注这些变化，并及时向检察院或您的辩护律师反映您的意见和诉求。
最后，我理解您在当前情况下的焦虑和不安。但请相信，法律会为您的权益提供保障。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会尽我所能为您提供专业、全面的法律服务。