起诉离婚时，若被告不配合调解，法院会依法进行判决。法院判决离婚的核心依据是夫妻感情是否确已破裂，而非被告是否配合调解。以下是对此问题的详细分析：

一、法院判决离婚的依据

根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。具体情形包括：

1. 重婚或者与他人同居；
2. 实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
3. 有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
4. 因感情不和分居满二年；
5. 其他导致夫妻感情破裂的情形。

若存在上述情形之一，且调解无效，法院应当准予离婚。

二、被告不配合调解的影响

被告不配合调解，并不影响法院对案件的审理和判决。法院会根据双方提交的证据和实际情况，判断夫妻感情是否确已破裂。若证据充分，能够证明夫妻感情确已破裂，即使被告不配合调解，法院也会依法判决离婚。

三、不同情况下的判决结果

1. 存在法定离婚情形：

   • 若原告能提供充分证据证明存在法定离婚情形，如重婚、家暴、分居满两年等，法院经审理认定夫妻感情确已破裂，会判决准予离婚。

2. 不存在法定离婚情形：

   • 若原告无法提供有效证据证明夫妻感情破裂，被告又坚决不同意离婚，法院通常会从维护婚姻稳定角度出发，判决不准予离婚。但原告在判决生效六个月后可再次起诉离婚，第二次起诉时，法院判决离婚的可能性通常会增大。

四、法律建议

1. 准备充分证据：

   • 在起诉离婚前，原告应准备充分证据，如结婚证、夫妻感情破裂的证据（如分居证明、家暴证据等）、财产证据等，以证明夫妻感情确已破裂。

2. 了解诉讼程序：

   • 原告应了解离婚诉讼的程序和要求，包括起诉状的撰写、证据的提交、开庭的准备等，以确保诉讼的顺利进行。

3. 寻求专业帮助：

   • 若对诉讼程序或法律条款不熟悉，原告可以寻求专业律师的帮助，以更好地维护自己的合法权益。

举例说明：假设一对夫妻因感情不和分居满两年，原告向法院提起离婚诉讼。在诉讼过程中，被告不配合调解。此时，原告应提交分居证明等证据，以证明夫妻感情确已破裂。法院在审理过程中，会依据双方提交的证据和实际情况，判断夫妻感情是否确已破裂。若证据充分，法院会依法判决离婚。

总之，起诉离婚时，若被告不配合调解，法院会依法进行判决。关键在于原告是否能提供充分证据证明夫妻感情确已破裂。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。