核心结论：二十多年前强拆厂房的损失计算需结合当时法律、证据情况及诉讼时效综合判断，具体需分情况分析。

1. 诉讼时效问题

根据《民法典》及相关司法解释，请求赔偿的诉讼时效为3年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算。若强拆发生在二十多年前，且期间未通过法律途径主张权利，可能因超过诉讼时效而丧失胜诉权。但若存在以下情形，时效可能中断或重新计算：

• 期间曾向相关部门主张权利（如信访、投诉）；
  
• 拆迁方曾承诺赔偿但未履行；
  
• 存在不可抗力或其他正当理由导致未能及时起诉。
  

建议：需先核查是否存在时效中断或中止的证据（如书面主张记录、政府回复等），若存在，仍可能主张权利。

2. 损失计算依据

若时效问题可解决，损失计算需结合当时法律与证据：

• 厂房价值：以强拆时厂房的市场价值为准，需提供评估报告、建造成本证明或同类厂房交易价格等证据；
  
• 停产停业损失：根据强拆前厂房的经营状况（如利润、订单量）计算，需提供财务报表、税务记录等；
  
• 搬迁费用：若需重新安置设备或物资，可主张实际支出费用；
  
• 其他损失：如设备损坏、原材料损失等，需提供购买凭证或评估报告。
  

难点：二十多年前的证据可能灭失（如财务记录、评估报告），需尽可能收集间接证据（如证人证言、照片、政府文件等）。

3. 法律适用问题

二十多年前，我国拆迁法律体系尚不完善，主要依据《城市房屋拆迁管理条例》（1991年施行，2001年修订）及地方性法规。若强拆行为违反当时法律（如未依法公告、未给予补偿），仍可主张违法拆迁赔偿。但需注意：

• 当时法律对补偿标准的规定较模糊，可能低于现行《国有土地上房屋征收与补偿条例》；
  
• 若强拆行为被后续法律认定为违法，可主张“国家赔偿”，但需通过行政诉讼程序。

4. 实务建议

1. 收集证据：优先查找强拆时的政府文件、补偿方案、评估报告等书面材料；若无直接证据，可尝试通过政府信息公开申请获取相关材料。
   
2. 咨询专业律师：结合证据情况，评估诉讼时效、法律适用及赔偿可行性，制定维权策略。
   
3. 协商或调解：若证据不足或时效风险高，可尝试与拆迁方或政府部门协商补偿。
   

总结：二十多年前强拆厂房的损失计算需综合时效、证据及法律适用，建议优先核查时效中断证据，再通过法律途径主张权利。若有具体材料或细节，可进一步向我咨询。