关于综合工时制周期结束时实际工作时间少于法定标准工作时间的问题，我们可以从以下几个方面来理解和处理：

结论前置

在综合工时制下，如果周期结束时员工实际工作时间少于法定标准工作时间，通常不需要进行特殊处理，因为这并不违反劳动法规。但用人单位应确保员工的工资支付不低于最低工资标准，且符合劳动合同约定。

详细分析

1. 综合工时制的定义与特点：

   • 综合工时制是一种特殊的工时制度，它允许在一定周期内（如周、月、季等）对工作时间进行灵活安排，只要周期内总工作时间不超过法定标准工作时间即可。
   • 这种制度适用于那些因工作性质特殊，需要连续作业或受季节、自然条件限制的岗位。

2. 实际工作时间少于法定标准工作时间的处理：

   • 在综合工时制下，员工在某个具体工作日或工作周期内的工作时间可能会少于法定标准工作时间，这是制度设计的一部分，旨在适应工作需求的变化。
   • 用人单位不需要因此对员工进行特殊处理，如补发工资或安排补班等。因为综合工时制的核心是周期内总工作时间的平衡，而不是每个具体工作日或工作周期的严格对等。

3. 工资支付与劳动合同约定：

   • 尽管实际工作时间可能少于法定标准工作时间，但用人单位应确保员工的工资支付不低于当地最低工资标准，并且符合劳动合同中的约定。
   • 如果劳动合同中有关于工作时间和工资支付的特别约定，用人单位应严格按照约定执行。

4. 法规依据：

   • 根据《劳动法》和《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》等相关法规，综合工时制是合法的工时制度，且未规定实际工作时间少于法定标准工作时间时需要特殊处理。

建议与总结

• 对于实行综合工时制的用人单位，应合理规划和安排员工的工作时间，确保周期内总工作时间不超过法定标准工作时间。
• 同时，用人单位应关注员工的工资支付情况，确保不低于最低工资标准，并符合劳动合同约定。
• 如果员工对工作时间或工资支付有疑问或争议，用人单位应及时与员工沟通解决，或咨询专业律师以获取法律意见。