机动车违反限行规定是一个常见的交通违规行为，其处理方式主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及各地区具体规定进行。以下是对此问题的详细解答：
一、处罚方式
罚款：
- 机动车驾驶人违反限行规定，通常会被处以一定数额的罚款。罚款金额因地区而异，一般在20元至200元之间，多数地区常见罚款金额为100元或200元。例如，在北京，驾驶当日限号车辆在限号区域通行，将罚款100元；而在上海，则罚款200元。
- 部分地区对于短期内多次违反限行规定的行为，会加重罚款力度。如某些城市规定，一个月内多次违反限行出行，除每次正常罚款外，还可能面临额外的高额罚款。
扣分：
- 违反限行规定有时会被扣除驾驶证分数，但并非所有地区都会实施扣分处理。一般来说，如果扣分，扣分数值为3分。然而，在特定情况下（如重大活动期间），扣分数值可能会增加。
- 也有一些地区对首次或前几次违反限行规定的车辆给予警告而不扣分，但从某次起（如第三次）开始罚款并记分。
其他处罚：
- 在极少数情况下，如果机动车违反限行规定的行为情节特别严重，或驾驶员同时存在其他严重交通违法行为，交通管理部门可能会暂扣其驾驶证或采取其他限制车辆使用的措施。
二、执法与抓拍方式
- 现场执法：交警在现场发现车辆违反限行规定时，会直接对驾驶员进行处罚，并要求出示驾驶证和行驶证。
- 电子监控抓拍：许多城市利用电子摄像头抓拍违反限行规定的车辆，并通过识别车辆号牌与限行数据库进行比对。车主会收到违章通知，并可通过交通管理部门的官方网站、手机APP等渠道查询具体违章情况。
三、特殊情况处理
- 紧急就医等特殊原因：因紧急就医等特殊、合理原因违反限行规定，可向当地交通管理部门说明情况并提供相关证明（如医院诊断书、病历等），申请撤销违章处罚。
- 外地车辆：部分城市对外地车辆的限行规定和本地车辆有所不同，处罚力度可能存在差异。部分城市对外地车辆首次违反限行规定会给予警告而非罚款扣分的处罚。
- 忘记限行日：在一些地区，如果确属忘记限行日、无意开车出门的车辆，在接受了一次处罚后，如果在规定时间内（如3个小时内）将车驶出限行区域，可能不用再次受罚。但一天内连续违反限行规定，将会被连续处罚。
四、缴纳罚款与后续处理
- 车主在收到违章通知后，应在规定时间内前往当地交通管理部门指定的地点接受处罚，或通过网上交通违法处理平台等方式完成处罚缴纳。
- 缴纳罚款的方式多样，包括银行代收点、交通管理部门的官方APP（如交管12123）、支付宝、微信等第三方支付平台。
- 当事人应当自收到罚款的行政处罚决定书之日起十五日内缴纳罚款。逾期未缴纳，可能会产生滞纳金，并影响驾驶证换证补证等业务的办理，甚至影响车辆保险理赔和车辆年审。
五、异议处理
如果对处罚存在异议，驾驶人有权向交警部门申请行政复议处理，以确保自身合法权益得到保障。
综上所述，机动车违反限行规定的处理方式和处罚标准因地区而异，但主要围绕罚款展开。驾驶人应密切关注当地交通管理部门的规定，严格遵守交通规则，以避免不必要的法律后果。同时，对于特殊情况或异议处理，也应及时向相关部门咨询或申请。