企业与政府的普通合作协议通常不属于行政诉讼范畴，而是属于民事诉讼范畴。以下是对此问题的详细分析：
一、行政诉讼与民事诉讼的基本区别
行政诉讼：主要解决的是行政机关与公民、法人或其他组织之间因行政行为而产生的争议。其核心在于审查行政行为的合法性，保护公民、法人或其他组织的合法权益不受行政行为的侵害。
民事诉讼：则主要解决平等主体之间的财产关系和人身关系争议。在民事诉讼中，双方当事人的地位平等，法院主要审查双方之间的民事法律关系是否合法、有效，以及是否存在违约、侵权等行为。
二、企业与政府合作协议的性质
企业与政府签订的普通合作协议，通常属于平等主体之间的民事合同关系。这种协议主要涉及双方的经济利益分配、合作方式、权利义务等条款，其本质是一种民事法律行为。除非该协议中明确包含了行政机关行使行政职权的内容，或者该协议的履行直接涉及到行政机关对特定事项的管理和审批，否则一般不被视为行政行为。
三、为何不属于行政诉讼
协议性质：如前所述，企业与政府签订的普通合作协议主要属于民事合同关系，而非行政行为。因此，因该协议产生的争议应通过民事诉讼途径解决。
诉讼目的：行政诉讼的主要目的是审查行政行为的合法性，而民事诉讼则主要解决平等主体之间的争议。在企业与政府合作协议纠纷中，双方争议的焦点通常是合同条款的解释、履行情况、违约责任等民事问题，而非行政行为的合法性。
法律适用：在行政诉讼中，法院主要依据行政法律法规进行审查；而在民事诉讼中，法院则主要依据民事法律法规进行裁判。对于企业与政府合作协议纠纷，应适用民事法律法规进行裁判。
四、特殊情况下的行政诉讼可能性
尽管企业与政府的普通合作协议通常不属于行政诉讼范畴，但在某些特殊情况下，该协议可能涉及行政机关的行政行为，从而引发行政诉讼。例如：
在这些特殊情况下，因协议产生的争议可能同时涉及民事和行政两个方面，需要综合考虑并选择合适的诉讼途径。不过，这种情况相对较少见，且需要具体分析协议内容和履行情况。
五、建议
对于企业与政府签订的普通合作协议纠纷，建议双方首先通过协商、调解等方式解决争议。如果无法达成一致，可以根据协议约定选择仲裁或诉讼途径解决。在选择诉讼途径时，应仔细分析协议性质和争议焦点，以确定是提起民事诉讼还是行政诉讼（在特殊情况下）。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。