针对您提出的“新车三轮减配应急灯是否合法”的问题，我们需要从相关法律法规的角度来进行分析。

首先，我们要明确的是，机动车的安全配置，包括应急灯等，都是车辆设计时的重要考虑因素，它们对于保障行车安全具有至关重要的作用。应急灯在车辆遇到紧急情况时，能够向其他道路使用者发出警示，从而避免或减少交通事故的发生。

接下来，我们参考《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定。该法第十六条明确指出，任何单位或者个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征。这意味着，如果新车在出厂时已经配备了应急灯，而后续被减配或拆除，那么这种行为很可能构成对机动车结构的擅自改变。

此外，虽然直接的法律条文可能并未明确提及“减配应急灯”这一具体行为，但我们可以从法律的精神和原则出发进行推断。法律保护的是道路交通的安全和秩序，任何可能危及这一安全和秩序的行为，都应当受到法律的制约和惩罚。减配应急灯，无疑会削弱车辆在紧急情况下的警示能力，从而增加交通事故的风险，这与法律的精神和原则是相悖的。

因此，结合上述分析，我们可以得出结论：新车三轮减配应急灯的行为，很可能违反了《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，是不合法的。为了保障行车安全，维护道路交通秩序，我们建议车主不要进行此类减配行为，并确保车辆的所有安全配置都处于完好状态。