证据的收集合法但证据的内容违法，在质证时该证据是否合法，不能一概而论，需结合具体情况综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、证据合法性要件
证据的合法性通常包括形式合法、收集程序合法等方面。若证据内容虽涉及违法行为，但其形式符合法律规定（如书面材料、录音录像等法定形式），且收集程序严格遵循法定要求（如通过合法的调查取证手段，未侵犯他人合法权益），那么该证据在形式上和程序上是合法的。例如，警方通过合法搜查获得的涉及犯罪的物证，即便物证本身指向违法行为，但因其收集程序合法，仍可作为定案依据。
二、收集程序违法性
若证据的取得存在违反法定程序的情况，即便其内容指向违法行为，也可能因收集程序违法而不具备合法性。例如，通过刑讯逼供、非法搜查、窃听等非法方式获取的证据，即便内容真实反映了违法行为，也会因收集手段违法而被排除，不能作为定案依据。这是因为非法收集证据的行为严重侵犯了公民的合法权益，违背了法治原则。
三、证据关联性
证据的合法性还可能受关联性等其他因素影响。如果证据内容虽涉及违法行为，但与待证事实缺乏关联性，即无法证明案件中的某个关键事实，那么该证据在诉讼中的证明力将大打折扣，甚至可能影响其合法性认定。例如，在某起盗窃案中，被告人曾有过其他违法行为，但该行为与本案盗窃事实无直接关联，那么该证据在本案中的合法性及证明力将受到质疑。
四、具体案例分析
以一起贩毒案件为例，警方通过合法手段（如监控、线人举报等）获得被告人贩卖毒品的证据，包括交易记录、毒品实物等。尽管这些证据内容直接指向了违法行为（贩卖毒品），但由于其收集程序合法，且形式符合法律规定，因此这些证据在质证时将被认定为合法证据，可用于证明被告人的犯罪事实。
反之，若警方通过非法手段（如刑讯逼供、非法搜查等）获得相同证据，那么即便证据内容真实，也会因收集程序违法而被排除，不能作为定案依据。
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