有营业执照的棋牌室抽头渔利是否违法，需结合具体行为性质来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合法经营与抽头渔利的界限

• 合法抽头：若棋牌室仅收取正常的场地费、服务费或设备使用费，且费用标准合理、透明，未超出市场正常水平，则属于合法经营范畴。这种情况下，抽头渔利并不违法。
• 非法抽头：若棋牌室通过抽头渔利的方式，从赌客的赌资中抽取一定比例作为利润，且该行为与赌博活动紧密相关，则可能构成违法。因为这种行为实质上是在为赌博活动提供便利，并从中获利，违反了《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关法律关于禁止赌博的规定。

2. 赌博行为的认定与法律后果

• 赌博行为的认定：根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第七十条，以营利为目的，为赌博提供条件的，或者参与赌博赌资较大的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款；情节严重的，处十日以上十五日以下拘留，并处五百元以上三千元以下罚款。因此，若棋牌室存在为赌博提供条件或参与赌博的行为，则可能面临行政处罚。
• 法律后果：除了行政处罚外，若棋牌室抽头渔利的行为构成犯罪（如开设赌场罪），则还可能面临刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》第三百零三条，开设赌场的，处五年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。

3. 合规经营的建议

• 明确经营范围：棋牌室应在营业执照规定的范围内经营，不得超范围经营或从事违法活动。
• 规范收费行为：棋牌室应制定合理的收费标准，并确保收费行为透明、合法。不得通过抽头渔利等方式从赌客的赌资中抽取利润。
• 加强内部管理：棋牌室应建立健全内部管理制度，加强对员工的教育和管理，防止员工参与或协助赌博活动。
• 配合监管检查：棋牌室应积极配合相关部门的监管检查，如实提供经营情况和相关资料。

4. 实际案例中的法律适用

• 在实际案例中，法院会根据棋牌室的具体经营行为、抽头渔利的性质和金额等因素来综合判断其是否违法。例如，若棋牌室仅收取正常的场地费和服务费，且未参与或协助赌博活动，则通常不会被认定为违法。反之，若棋牌室通过抽头渔利的方式为赌博活动提供便利，并从中获取大量利润，则可能构成违法甚至犯罪。

总结与建议： 有营业执照的棋牌室抽头渔利是否违法，需结合具体行为性质来判断。若棋牌室仅收取正常的场地费和服务费，且未参与或协助赌博活动，则属于合法经营范畴。反之，若棋牌室通过抽头渔利的方式为赌博活动提供便利，并从中获取利润，则可能构成违法甚至犯罪。因此，建议棋牌室在经营过程中严格遵守相关法律法规，规范收费行为，加强内部管理，并积极配合相关部门的监管检查。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。