在工程合同中，履约保证金条款的约定是确保合同双方权益得到有效保障的关键环节。以下是对工程合同履约保证金条款如何约定的详细解答：
一、履约保证金的数额
确定原则：履约保证金的数额通常根据合同标的额的大小、工程风险程度以及双方协商的结果来确定。这一数额应既能体现对合同履行的保障，又不会给一方造成过大的经济负担。
法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，定金的数额不得超过主合同标的额的百分之二十。虽然履约保证金与定金在性质上略有不同，但此规定可作为确定履约保证金数额的参考上限，以避免数额过高可能带来的法律风险。
协商确定：在实际操作中，双方应根据工程的具体情况、市场惯例以及双方的谈判地位，协商确定一个合理的履约保证金数额。
二、履约保证金的期限
生效时间：履约保证金的生效时间应明确约定，通常与合同生效时间一致，或根据工程进度、付款节点等具体情况进行约定。
失效时间：履约保证金的失效时间也应明确约定，通常与工程竣工验收合格、质保期满或合同约定的其他终止条件相一致。
分期支付与退还：如双方约定分期支付履约保证金，则应明确每期的支付时间、金额及条件；同时，也应约定在何种情况下可以退还保证金，以及退还的方式和时间。
三、违约责任
违约情形：双方应明确约定在何种情况下视为违约，包括但不限于未按时开工、未按时完工、工程质量不符合约定、未支付工程款等。
责任承担：违约方应承担的责任和赔偿方式也应明确约定，包括但不限于支付违约金、赔偿损失、继续履行合同等。违约金的数额或计算方式应具体明确，以便在违约发生时能够迅速确定责任。
担保方式：除了履约保证金外，双方还可以考虑采用其他担保方式，如银行保函、第三方担保等，以进一步保障合同的履行。银行保函是一种常见的担保方式，由商业银行开具担保证明，通常为合同金额的10%左右。银行保函又分为有条件的银行保函和无条件的银行保函两种形式，双方应根据实际情况选择适合的担保方式。
四、其他注意事项
合同签订原则：合同签订应遵循平等自愿、公平诚信的原则，明确约定合同标的、工期、质量标准、付款方式等关键条款。同时，双方还应充分了解并遵守相关法律法规和政策规定，确保合同的合法性和有效性。
争议解决：双方应约定在合同履行过程中如发生争议，应如何解决，包括但不限于协商、调解、仲裁或诉讼等方式。
综上所述，工程合同履约保证金条款的约定应全面、具体、明确，以确保合同双方权益得到有效保障。在签订合同时，双方应充分协商、明确约定各项条款，并遵守相关法律法规和政策规定。