在办理退休时，如果发现个人有犯罪记录或涉及违纪违法行为，处理方式会依据具体情况和相关法律法规进行。以下是对这一问题的详细解答：

一、立案程序的启动

1. 对于中共党员：

   • 如果退休前或退休后有违纪违法行为，由于纪律审查没有追究时效限制，可以进行党纪立案。

2. 对于非中共党员：

   • 依据监察法和政务处分法的相关规定，监察机关可以立案调查，并不因其退休而不能管辖。
   • 实践中，如果没有违法所得，一般需提前研判依法应给予的处分档次。根据立案必要性区分情况处理：
     • 依法应给予政务警告、记过、记大过处分的，由于处分对行为人职务、职级、级别、工资档次等不产生影响，一般不建议立案，可按照干部管理权限，在线索处置或初核阶段直接或委托有关机关、组织，对其予以谈话提醒、批评教育、责令检查或者予以诫勉。
     • 应给予降级及以上处分或涉嫌职务犯罪的，由于涉及调整退休待遇问题，需进行政务立案。

二、立案主体的确定

• 公职人员不因退休而改变原干部管理权限，对其立案应根据办理退休手续时的干部管理权限确定立案主体。
• 需注意的是，公职人员退休后因党组织关系转移导致与干部管理权限相分离的问题。例如，某省A市一处级干部退休后党组织关系转到本省B市某基层社区党支部，对其退休前违纪违法问题，B市纪委根据党组织隶属关系具有优先管辖权。但如果违纪行为主要发生在A市，由A市调查更为适宜的，经与B市纪委协商，也可以进行立案。此种情形下双方需注意加强衔接配合、及时相互通报情况。

三、退休待遇的调整

• 如果退休公职人员被发现有严重违纪违法行为，其退休待遇可能会受到影响。
• 调整退休公职人员享受的待遇是其承担纪法责任的一种形式，属于政务处分的延伸。实践中，调整方式主要有三种：
  1. 在党纪处分决定文书中直接表述待遇调整事项。
  2. 参照政务重处分决定书要求，按照管理权限，单独作出《关于调整××退休待遇的决定》。
  3. 将“相应调整其享受的待遇”书面通知同级党委组织部门和所在单位按程序予以落实。建议采用第三种方式为宜，可灵活采取制发通知书、发函等形式，由组织部门和所在单位依规予以调整。

四、特殊情况的待遇处理

• 对于退休公务员被采取强制措施或受行政、刑事处罚的待遇处理，根据人社部等相关文件规定，会有不同的处理方式。例如：
  • 被行政拘留期间，按原基本退休费75%计发生活费，期满后要按2%降低基本退休费。
  • 被判处有期徒刑以上刑罚的，从法院判决生效之日起取消原退休费待遇。
  • 被判处管制、拘役或拘役被宣告缓刑、有期徒刑被宣告缓刑期间的，停发退休费待遇，按本人原基本退休费60%计发生活费，刑罚执行完毕或缓刑考验期满不再执行原判刑罚的，按40%降低基本退休费，补贴按办事员确定。

五、建议与注意事项

• 在办理退休过程中，如果发现个人有犯罪记录或涉及违纪违法行为，建议主动向相关部门说明情况，并配合调查。
• 遵守法律法规，积极改正错误，是减轻或避免不利后果的关键。
• 如有疑问或需要进一步的法律帮助，建议咨询专业的法律人士或相关部门。

综上所述，办理退休时发现有犯罪记录或涉及违纪违法行为，会根据具体情况和相关法律法规进行立案、处分和待遇调整。建议个人在办理退休过程中保持诚信，遵守法律法规，如有任何问题及时咨询并配合相关部门处理。