公司与员工签订劳务协议是否违法，需根据双方实际关系性质判断。

一. 劳务协议与劳动关系的区分

1. 合法情况：若公司与员工之间实际形成的是劳务关系，即员工具有较强的独立性，不受公司过多的管理约束，且工作成果是一次性交付的，那么签订劳务协议是合法的。劳务合同作为民事合同，是双方平等协商达成的，就某一项劳务及劳务成果所达成的协议，适用民法典和其他民事法律调整。

2. 违法情况：然而，若双方实际上形成的是劳动关系，但公司却与员工签订劳务协议，以规避劳动法规定的用人单位应承担的义务（如缴纳社保、支付加班工资等），这种做法则是不合法的。此时，公司应与员工签订劳动合同，并承担相应的劳动法律责任。

二. 判断依据

判断公司与员工之间到底是劳动关系还是劳务关系，需要综合考虑工作时间、工作方式、报酬支付等多个因素。若员工认为公司错误地签订了劳务协议，损害了自己的权益，可以通过劳动仲裁或诉讼的方式来维护自己的合法权益。

三. 相关法条

• 《中华人民共和国劳动合同法》及相关实施条例对劳动合同的签订、履行等作了明确规定，强调了用人单位与劳动者建立劳动关系时必须签订书面劳动合同的义务。
• 若公司未依法与员工签订劳动合同，将可能面临支付双倍工资、视为订立无固定期限劳动合同等法律后果。

我建议，公司在与员工签订协议时，应明确双方关系的性质，并根据实际情况选择合适的合同类型。如双方存在劳动关系，应依法签订劳动合同，以保障双方的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。