在投标文件中，若正本与副本的实质性条款存在不一致，不能简单地以正本为准，而需根据具体情况及相关法律规定来处理。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 从合同订立的角度分析：

   • 投标文件是合同订立过程中的重要文件，其内容应当准确、一致。若正本与副本的实质性条款不一致，可能反映出投标人在准备投标文件时的疏忽或错误。
   • 在此情况下，若直接以正本为准，可能会忽视副本中的有效信息或对另一方造成不公平。因此，更合理的做法是要求投标人澄清或修正不一致之处，以确保合同的公平性和准确性。

2. 从法律规定的角度分析：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，投标文件应当符合招标文件的要求，且正本与副本应当一致。若存在不一致，招标人有权要求投标人进行澄清或说明。
   • 若投标人未能及时澄清或说明，或者澄清、说明后仍存在不一致，招标人可能会根据具体情况决定是否接受该投标文件。在某些情况下，不一致可能被视为投标文件的重大缺陷，导致投标被拒绝。

3. 从实际操作的角度分析：

   • 在实际操作中，若发现投标文件正本与副本的实质性条款不一致，招标人通常会先与投标人进行沟通，要求其澄清或修正不一致之处。
   • 若投标人能够提供合理的解释或修正方案，且该方案符合招标文件的要求，那么招标人可能会接受该投标文件。反之，若投标人无法提供合理的解释或修正方案，或者修正后的方案仍不符合招标文件的要求，那么招标人可能会拒绝该投标文件。

4. 法律建议：

   • 对于投标人而言，在准备投标文件时应当仔细核对正本与副本的内容，确保其一致性和准确性。若发现不一致，应当及时进行修正或说明。
   • 对于招标人而言，在收到投标文件后应当仔细审查其内容，若发现正本与副本的实质性条款不一致，应当及时与投标人进行沟通并要求其澄清或修正。在处理此类问题时，应当遵循公平、公正、透明的原则，确保招标过程的合法性和有效性。

若在实际操作中遇到此类问题，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。作为专注于保险理赔、建设工程领域的律师，我具备处理此类合同纠纷问题的专业能力。若您有任何相关法律问题，可以直接向我咨询。