1. 结论：在黑社会性质组织犯罪案件中，即便组织内部已经分了层级，仍然需要区分主从犯。

2. 分析：

   • 法律原则：根据我国刑法的基本原则，对于共同犯罪案件，应当根据各被告人在共同犯罪中的地位、作用，分别确定主犯、从犯。这一原则同样适用于黑社会性质组织犯罪案件。黑社会性质组织虽然有其特殊的组织结构和运作方式，但并不改变其共同犯罪的本质。
   • 层级与主从犯的关系：黑社会性质组织内部可能存在不同的层级，如领导者、骨干成员、一般成员等。这些层级主要反映了组织内部的权力结构和职责分工，但并不直接决定各成员在共同犯罪中的地位和作用。因此，不能仅凭层级来划分主从犯，而应当综合考虑各成员在犯罪活动中的实际参与程度、对犯罪结果的影响等因素。
   • 区分主从犯的意义：区分主从犯对于准确认定各被告人的刑事责任、实现罪刑相适应原则具有重要意义。主犯通常对犯罪活动的发起、策划、指挥或主要实施负有直接责任，应当承担较重的刑事责任；而从犯则可能仅起辅助作用或次要作用，其刑事责任相对较轻。

3. 法律建议：

   • 对于涉及黑社会性质组织犯罪的案件，被告人及其辩护人应当充分了解并运用区分主从犯的法律原则，为被告人争取合理的刑事责任认定。
   • 在案件审理过程中，被告人及其辩护人可以通过提供证据、发表辩护意见等方式，证明被告人在共同犯罪中的地位和作用，从而争取更轻的刑事处罚。

4. 可能的法律后果：

   • 如果被告人被认定为黑社会性质组织的主犯，将可能面临更严厉的刑事处罚，包括较长的有期徒刑、无期徒刑甚至死刑（在特定情况下）。
   • 如果被告人被认定为从犯，其刑事责任将相对减轻，可能获得较轻的刑罚或缓刑等处理。

综上所述，即便黑社会性质组织内部已经分了层级，仍然需要区分主从犯。这一区分对于准确认定各被告人的刑事责任、实现罪刑相适应原则具有重要意义。如有相关法律问题，可以直接向我咨询。