结论前置：男方入赘女方，男方父亲有案底，在一般情况下不会直接影响孩子，但在孩子报考特殊学校或从事特定行业时，可能会因政审而受到一定影响。

1. 对孩子日常生活的影响：

   • 在孩子的日常生活中，如上学、就医、出行等，男方父亲的案底通常不会产生直接影响。孩子可以正常享受这些基本服务和权益。
   • 然而，当孩子面临报考对家庭成员政治背景有严格要求的特殊学校（如军事院校、航空航天院校的某些特殊专业）或未来从事涉及国家安全、国防等特定行业的工作时，男方的案底可能会成为政审环节的一个考虑因素，从而影响孩子的报考或就业。

2. 法律层面的分析：

   • 从法律角度来看，男方的案底是其个人的违法犯罪记录，法律责任由其个人承担。孩子在法律上是独立的个体，不会因父母一方的案底而直接承担法律责任。
   • 但在某些特定的法律情境中，如涉及国家秘密、敏感信息的工作领域，需要对从业人员及其家庭成员进行严格的政治审查。此时，男方的案底可能会成为影响孩子报考或就业的一个间接因素。

3. 户口登记的相关规定：

   • 孩子上户口主要依据户籍管理规定和政策，以亲子关系为基础。提供合法的亲子证明（如出生证明）并符合当地户口登记的具体要求，孩子即可正常上女方户口。
   • 男方父亲的案底本身不是孩子上女方户口的障碍。但在办理户口过程中，如果遇到与男方父亲案底相关的问题或疑问，建议咨询当地户籍管理部门以获取准确指导。

4. 建议与后续行动：

   • 如果孩子未来有报考特殊学校或从事特定行业的打算，建议提前了解相关政审要求和标准，以便做好充分准备。
   • 在日常生活中，可以关注孩子的心理健康和成长环境，避免因男方父亲的案底而给孩子带来不必要的心理压力或负面影响。
   • 如有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。

综上所述，男方入赘女方，男方父亲有案底在一般情况下不会直接影响孩子，但在特定情况下可能会因政审而受到一定影响。因此，在处理相关事务时，应充分了解具体规定和要求，并咨询相关部门以获取准确指导。如有任何法律问题或疑虑，欢迎随时向我咨询。