针对您提出的“已满16周岁不满18周岁的人犯罪，犯罪档案要怎么处理”的问题，以下是我为您提供的清晰、详细、有深度的解答：

首先，需要明确的是，对于已满16周岁不满18周岁的人犯罪，我国法律有专门的未成年人犯罪记录封存制度。这一制度旨在保护未成年人的隐私和权益，帮助他们更好地回归社会。

一、未成年人犯罪记录封存制度的基本内容

1. 封存对象：

   • 主要针对犯罪时未满18周岁的未成年人。
   • 被判处五年有期徒刑以下刑罚或免予刑事处罚的未成年人犯罪记录，应当予以封存。

2. 封存内容：

   • 涉及未成年人案件的所有材料，包括刑事案件程序中的材料、社会调查记录、帮教考察记录等，都应当予以封存。
   • 对于共同犯罪案件，分案后未封存的成年人卷宗封皮应当标注“含犯罪记录封存信息”，并对相关信息采取必要保密措施。

3. 封存措施：

   • 纸质卷宗、档案材料等应当加密保存，不得公开。
   • 电子数据也应当同步封存、加密、单独管理，并设置严格的查询权限。
   • 司法机关工作人员负有保密义务，不得泄露未成年人涉案信息。

二、未成年人犯罪记录封存的具体操作

1. 申请封存：

   • 一般情况下，未成年人犯罪记录封存不需要主动申请，司法机关在判决后会主动进行封存。
   • 但如果存在特殊情况或需要进一步确认封存情况，未成年人或其法定代理人可以向相关司法机关提出申请。

2. 审核与决定：

   • 司法机关会对申请进行审核，包括犯罪者的犯罪情况、服刑情况、社会表现等。
   • 审核通过后，司法机关会做出封存决定，并出具正式的封存决定书。

3. 封存记录：

   • 一旦做出封存决定，相关机构会将犯罪记录进行封存处理，不再对外公开。
   • 同时，对于涉及个人隐私的信息也会进行相应的保护。

三、注意事项

1. 封存不等于消除：

   • 封存并不等同于消除犯罪记录，犯罪记录仍然存在于相关机构的档案中，只是不对外公开而已。

2. 法定情况下的解封：

   • 未成年人犯罪记录封存后，非因法定情况（如再次犯罪等），不得解封。

3. 地区差异：

   • 未成年人犯罪记录封存制度的具体操作可能因地区而异，具体操作还需根据当地的法律法规和相关规定进行。

综上所述，对于已满16周岁不满18周岁的人犯罪，其犯罪记录在符合法定条件的情况下应当予以封存。这一制度旨在保护未成年人的隐私和权益，帮助他们更好地回归社会。如果您或您的家人有类似情况，建议咨询当地司法机关或专业律师以获取更详细和准确的信息。