实际施工人能否直接向发包人主张停工损失，需分情况讨论：

1. 存在挂靠关系且发包人明知时：

   • 若实际施工人与承包人之间存在挂靠关系，且发包人在签订合同时已经明知实际施工人为借用他人资质，那么被挂靠方与发包人就建设特定工程实际上缺乏相互设定权利义务的合意。此时，挂靠方与发包人围绕合同订立、履行合同形成了事实上建设工程施工合同关系。
   • 在这种情况下，挂靠方（即实际施工人）有权基于事实上的合同关系向发包人主张包括停工损失在内的工程款相关权益。因为停工损失是实际施工人在施工过程中因发包人原因或其他不可抗力因素导致的直接经济损失，实际施工人有权要求发包人进行赔偿。

2. 不存在挂靠关系或发包人不知情时：

   • 若实际施工人与承包人之间不存在挂靠关系，或者发包人在签订合同时并不知情实际施工人为借用他人资质，那么实际施工人通常不能直接向发包人主张停工损失。
   • 在这种情况下，实际施工人应首先向与其有合同关系的承包人主张停工损失。若承包人拒绝赔偿或无力赔偿，实际施工人可根据合同约定或法律规定，通过诉讼或仲裁等方式向承包人追偿。同时，若停工损失是由发包人原因导致的，实际施工人也可在向承包人主张权利的同时，要求承包人向发包人转达其主张，或协助其向发包人追偿。

3. 合同有特别约定时：

   • 若建设工程施工合同中有关于停工损失承担的特别约定，如约定停工损失由发包人直接承担，或约定实际施工人在特定情况下可直接向发包人主张停工损失等，那么实际施工人应按照合同约定行使权利。
   • 在这种情况下，实际施工人可直接依据合同约定向发包人主张停工损失，而无需考虑是否存在挂靠关系或发包人是否知情等因素。

法律建议：

• 作为实际施工人，在遭遇停工损失时，应首先审查与承包人之间的合同关系及合同约定，明确停工损失的承担方及主张方式。
• 若存在挂靠关系且发包人明知，或合同有特别约定时，实际施工人可直接向发包人主张停工损失。但在此过程中，需注意收集并保留相关证据，如停工通知、损失计算依据、与发包人的沟通记录等，以支持其主张。
• 若不存在挂靠关系或发包人不知情，或合同无特别约定时，实际施工人应首先向与其有合同关系的承包人主张停工损失。若承包人拒绝赔偿或无力赔偿，可考虑通过诉讼或仲裁等方式向承包人追偿，并要求承包人协助向发包人追偿。

总结：

实际施工人能否直接向发包人主张停工损失，需根据具体情况进行判断。在存在挂靠关系且发包人明知、合同有特别约定等情况下，实际施工人可直接向发包人主张停工损失；而在不存在挂靠关系或发包人不知情、合同无特别约定等情况下，实际施工人应首先向与其有合同关系的承包人主张停工损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。