针对您提出的“违停司机在车上怎么处罚”的问题，我将根据相关法律法规和执法实践，为您提供一个清晰、详细且有深度的解答。
首先，当交警发现车辆违停且驾驶人在车上时，通常会采取以下处理方式：
口头警告并要求驶离：
- 交警会首先指出您的违法行为，并给予口头警告，要求您立即驶离违停地点，前往合法停车区域。
- 这一步骤的法律依据是《中华人民共和国道路交通安全法》第九十三条，该法条规定对违反机动车停放规定的，可以指出违法行为，并予以口头警告，令其立即驶离。
若拒绝驶离的处理：
- 如果您拒绝驶离或继续违停，且该行为妨碍了其他车辆或行人的正常通行，交警将依法对您进行罚款处罚。
- 罚款金额一般会在二十元以上二百元以下，具体数额会根据违停的严重程度和当地交通管理规定来确定。
- 在某些情况下，如果车辆严重妨碍交通，交警部门还有权将该机动车拖移至不妨碍交通的地点或指定地点停放。但拖车不得向当事人收取费用，并应当及时告知当事人停放地点。若因拖车不当导致机动车损坏，交警部门需依法承担补偿责任。
接下来，我想强调一些特殊情况的处理：
- 因紧急情况临时停车：如果您因突发疾病、车辆故障等紧急情况而不得不临时违停，并能提供合理证明或解释，交警通常会先解决紧急问题，再根据具体情况决定是否处罚。
- 执行特殊任务：若您的车辆在执行紧急公务、抢险救灾、医疗救护等特殊任务，且您能出示相关证件或证明文件，即使违停也不会被处罚。
最后，关于扣分的问题，根据目前的交通法规，单纯的违章停车行为（未造成其他严重后果的）通常不会导致驾驶证被扣分。扣分主要出现在如超速、闯红灯等更为严重的交通违法行为中。
综上所述，对于违停且驾驶人在车上的情况，处理方式主要取决于您的行为及是否妨碍交通。交警会首先采取口头警告并要求驶离的措施，若您配合则免罚；若拒绝驶离或继续违停并妨碍交通，则将面临罚款甚至拖车处理。在特殊情况下，交警会酌情处理。同时，单纯的违停行为通常不会涉及扣分。希望这个解答能对您有所帮助。