针对您提出的“对非营利性医疗机构处罚金额多大才算重大处罚”这一问题，我们需要从相关法律法规和行政处罚程序的角度来进行分析。
首先，根据《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》的相关规定，对于非营利性医疗卫生机构向出资人、举办者分配或者变相分配收益的行为，县级以上人民政府卫生健康主管部门有权责令改正，没收违法所得，并处违法所得二倍以上十倍以下的罚款。若违法所得不足一万元，则按一万元计算。这是对非营利性医疗机构此类违规行为的基本处罚标准。
接下来，关于“重大处罚”的界定，这通常并非单纯由处罚金额的大小来决定，而是需要综合考虑多个因素，包括但不限于：
违法行为的性质与严重程度：如果非营利性医疗机构的违规行为涉及金额巨大、影响范围广泛，或者对公众健康造成了严重威胁，那么即使处罚金额不是特别高，也可能被视为重大处罚。
处罚金额与机构规模、财务状况的对比：对于一家规模较小、财务状况不佳的非营利性医疗机构来说，即使处罚金额相对较低，也可能对其运营造成重大影响，从而被视为重大处罚。
行政处罚程序中的集体讨论：根据行政处罚程序，对于属于重大行政处罚的案件，应依照相关规定进行集体讨论。这意味着，在决定是否构成重大处罚时，除了考虑处罚金额外，还会综合考虑案件的其他相关因素。
社会影响与公众关注度：如果非营利性医疗机构的违规行为引起了广泛的社会关注和公众不满，那么即使处罚金额不是特别高，也可能因为其社会影响而被视为重大处罚。
综上所述，对于“对非营利性医疗机构处罚金额多大才算重大处罚”这一问题，并没有一个固定的金额标准。而是需要综合考虑违法行为的性质、严重程度、处罚金额与机构规模、财务状况的对比、行政处罚程序中的集体讨论以及社会影响与公众关注度等多个因素来综合判断。
在实际操作中，卫生健康主管部门会根据具体情况进行评估和判断，并依法作出相应的行政处罚决定。如果您对具体的处罚决定有疑问或不满，可以通过合法途径进行申诉或维权。