数科金融借款逾期后，银行或金融机构有权按照贷款合同的约定从借款人账户中扣款以偿还逾期贷款，借款人无法直接协商退回已扣款项，但可以尝试与银行或金融机构协商后续还款事宜。

一. 借款逾期的法律后果

1. 依据《中华人民共和国民法典》第六百七十五条，借款人应当按照约定的期限返还借款。对借款期限没有约定或者约定不明确，依据本法第五百一十条的规定仍不能确定的，借款人可以随时返还；贷款人可以催告借款人在合理期限内返还。在数科金融借款逾期的情况下，银行或金融机构有权按照贷款合同的约定，从借款人的账户中扣款以偿还逾期贷款。

二. 协商退回已扣款项的可能性

1. 取决于贷款合同和银行政策：已扣款项是银行或金融机构依据贷款合同行使其权利的结果，因此，借款人无法直接协商退回。但借款人可以尝试与银行或金融机构沟通，提出协商请求，说明自身情况，并寻求可能的解决方案。
2. 需双方协商确定：根据《中华人民共和国民事诉讼法》第九十九条，调解达成协议，必须双方自愿，不得强迫。调解协议的内容不得违反法律规定。因此，最终能否协商成功以及退款金额、时间等具体事宜，需由借款人与银行或金融机构双方共同协商确定。

三. 后续建议

1. 及时与银行或金融机构沟通：借款人应尽快与银行或金融机构取得联系，说明逾期原因，表达还款意愿，并尝试协商后续还款计划。
2. 保留相关证据：借款人在与银行或金融机构沟通时，应保留好相关通话记录、短信、邮件等证据，以备后续可能需要使用。

我建议，在面临数科金融借款逾期的情况时，借款人应保持冷静，积极与银行或金融机构沟通，并寻求专业的法律建议。如有进一步需要，您可以继续咨询我。