在刑事拘留期间，如果当事人的配偶注销了其微信号，警方会依法处理。以下是对此情况的详细分析：
一. 警方对证据的保护
法律依据：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十四条，人民法院、人民检察院和公安机关有权向有关单位和个人收集、调取证据。在刑事拘留期间，手机及其中的数据都可能被视为重要的证据。
证据的重要性：微信作为手机中的一个应用程序，包含了大量的用户数据和信息，这些信息在刑事案件中可能具有重要的证据价值。注销微信可能导致这些信息被永久删除，从而影响案件的调查和审判。
二. 擅自注销微信的法律责任
可能的法律后果：如果个人在警方扣押手机期间擅自注销微信，可能会面临法律责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，对计算机信息系统中存储、处理或者传输的数据进行删除、修改等操作，如果后果严重，可能会构成犯罪。
警方的应对措施：警方可能会对此进行调查，以确定是否存在违法行为，并依法采取相应的法律措施。
三. 警方对注销微信号的处理
数据保留与调取：即使微信号已经注销，相关数据并不会立即从服务器中删除。在微信号注销后的一段时间内（具体时间取决于微信的数据保留政策），这些数据仍然可以被公安机关通过合法途径获取。这些数据可能包括用户注销前的聊天记录、交易记录等，都可以作为刑事犯罪的证据。
警方的调查权限：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十四条，公安机关在刑事侦查过程中有权向有关单位和个人收集、调取证据。这意味着，如果警方认为有必要，他们可以依法向微信运营商或相关机构发出查询请求，以获取已注销微信账号的相关信息。
我的建议：在刑事拘留期间，当事人及其家属应严格遵守相关法律法规，不得擅自对可能作为证据的数据进行任何修改、删除或注销等操作。如有进一步需要，您可以继续咨询我。