在超车追尾且对方被判定为全责的情况下，保险公司赔偿的款项支付问题通常遵循以下原则：
首先，要明确的是，在一般的保险理赔流程中，当被保险车辆（即全责方车辆）发生事故并造成损失时，保险公司通常会将理赔款支付给被保险人，也就是与保险公司签订保险合同的一方。这里的被保险人，在超车追尾且对方全责的情境下，实际上指的是全责方车辆的所有人或投保人。
然而，在超车追尾事故中，如果全责方造成了对方车辆的损失或人员伤亡，那么保险公司的赔偿流程会稍有不同。具体来说：
对于对方车辆的损失：保险公司会在交强险和商业险的责任限额内，根据实际损失情况，将理赔款支付给全责方（被保险人）。随后，全责方需要将这些赔款转交给事故中的受害方（即被追尾方），以弥补其车辆损失。在实际操作中，全责方可能会先行垫付修车费用给对方车主，之后保险公司再将相应赔款赔付给全责方，用于弥补其垫付的支出。
对于涉及人身伤亡的赔偿：全责方需要提供相关证明材料，如医疗费用发票、伤残鉴定报告等，以协助保险公司进行审核。审核通过后，赔款会支付给全责方，再由全责方按照责任划分和实际情况转付给伤亡受害者或其家属，以确保受害者能及时获得赔偿用于治疗等费用支出。
此外，还需要注意的是，具体的赔偿流程和款项支付方式可能会因保险公司的不同而有所差异。有些保险公司可能会直接将赔款支付给受害方或指定的修理厂，以简化流程并确保受害者能及时获得赔偿。因此，在实际操作中，建议全责方与保险公司保持密切沟通，了解具体的赔偿流程和款项支付方式。
综上所述，超车追尾且对方全责时，保险公司赔偿的款项通常会先支付给全责方（被保险人），再由全责方转交给受害方。但具体的赔偿流程和款项支付方式可能会因保险公司的不同而有所差异，建议在实际操作中与保险公司保持密切沟通。