在建设工程合同纠纷中，施工单位严重违约导致被清除退场的情形通常包括以下几种：

1. 工程质量严重不合格：

   • 若施工单位在施工过程中，未按照合同约定的质量标准或国家相关规范进行施工，导致工程质量严重不合格，且经整改后仍无法达到要求，建设单位有权要求施工单位清除退场。这种情况下，施工单位不仅需承担整改费用，还可能面临违约责任赔偿。

2. 工期严重延误：

   • 施工单位若因自身原因（如管理不善、资源不足等）导致工期严重延误，且无法在合理期限内完成工程，建设单位有权根据合同约定解除合同，并要求施工单位清除退场。此时，施工单位需承担因工期延误给建设单位造成的损失，包括但不限于延期交付的违约金、额外租赁费用等。

3. 安全施工违规：

   • 施工单位在施工过程中，若存在严重违反安全施工规定的行为，如未设置必要的安全防护措施、使用不合格的安全设备等，导致发生重大安全事故或存在严重安全隐患，建设单位有权立即要求施工单位停止施工并清除退场。这种情况下，施工单位需承担相应的法律责任和赔偿责任。

4. 转包或违法分包：

   • 若施工单位将工程转包给不具备相应资质的单位或个人，或违法分包给多个单位或个人进行施工，建设单位有权解除合同并要求施工单位清除退场。转包和违法分包不仅违反了合同约定，还可能影响工程质量和安全，因此建设单位有权采取严厉措施。

5. 拒绝履行合同义务：

   • 施工单位在合同履行过程中，若明确表示或行为上表现出拒绝履行合同主要义务（如不支付工人工资、不提供必要材料等），建设单位有权根据合同约定解除合同，并要求施工单位清除退场。此时，施工单位需承担因拒绝履行合同义务给建设单位造成的损失。

针对施工单位严重违约导致被清除退场的情形，法律建议如下：

• 建设单位：在发现施工单位存在严重违约行为时，应及时收集证据并按照合同约定或法律规定采取措施，如要求施工单位整改、解除合同并要求清除退场等。同时，建设单位还需注意保留好相关证据，以便在后续可能发生的纠纷中维护自身权益。

• 施工单位：应严格遵守合同约定和国家相关法律法规进行施工，确保工程质量和安全。若因自身原因导致违约行为发生，应积极与建设单位沟通协商解决方案，并承担相应的违约责任和赔偿责任。同时，施工单位还需加强内部管理和资源调配能力，避免类似违约行为再次发生。

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