当您的起诉申请伤残鉴定被法院驳回时，不必过于焦虑，您可以按照以下步骤来妥善处理这一问题，以维护自己的合法权益：

一、研究驳回理由

首先，您需要仔细研究法院驳回伤残鉴定的具体理由。这通常包括鉴定的程序是否合规、鉴定的依据是否充分和准确，以及是否存在其他影响鉴定结果有效性的因素。通过深入研究驳回理由，您可以明确问题所在，为后续的处理提供方向。

二、与鉴定机构沟通

在明确了驳回理由后，您应及时与鉴定机构进行沟通。探讨是否能够对鉴定内容进行补充或修正，比如补充一些遗漏的关键信息、修正一些错误的判断等。如果确实存在需要重新鉴定的情况，您应确保符合法律规定的条件，如发现了新的重要证据，这个证据对伤残鉴定结果可能会产生实质性的影响等。

三、准备证据材料

为了有力地支撑您的伤残事实，您需要精心准备充足的证据材料。这些材料可以包括详细的病历、每一次的就诊记录、检查结果、治疗方案等，以及完整的治疗记录，能反映出整个治疗过程以及病情的发展变化等。这些证据材料将在重新鉴定或后续的诉讼进程中发挥重要作用。

四、考虑重新鉴定

如果经过与鉴定机构的沟通和准备证据材料后，您认为有必要进行重新鉴定，那么您可以向法院提出重新鉴定的申请。在申请时，您需要明确说明重新鉴定的理由和依据，并提供相关证据材料来支持您的申请。法院在收到您的申请后，会根据法律规定和实际情况来决定是否准许重新鉴定。

五、遵循法律程序

在重新鉴定或后续的诉讼进程中，您必须严格地遵循法律程序和要求。从申请到实施，每一个环节都要做到合规合法。这包括但不限于提交申请的时间、方式、内容，以及参与鉴定或诉讼的流程和规定等。通过遵循法律程序，您可以确保自己的合法权益得到合理的维护。

六、寻求专业法律帮助

如果您在处理这一问题的过程中遇到困难或不确定如何操作，您可以寻求专业法律帮助。律师可以为您提供专业的法律意见和指导，帮助您更好地处理这一问题并维护自己的合法权益。

总之，当您的起诉申请伤残鉴定被法院驳回时，您需要保持冷静并按照上述步骤来妥善处理这一问题。通过深入研究驳回理由、与鉴定机构沟通、准备证据材料、考虑重新鉴定、遵循法律程序以及寻求专业法律帮助等措施，您可以更好地维护自己的合法权益并争取到应有的赔偿。