在红绿灯底下站错道逆行是会扣分的。具体扣分情况如下：
一般情况：根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》的规定，如果在市区内的红绿灯路口逆向行驶，一次将被记3分。
特殊情况：如果是在高速公路上逆向行驶，包括倒车、逆行、穿越中央分隔带掉头等，处罚将更为严厉，一次将被记12分。但请注意，这一特殊条款通常不适用于普通的红绿灯路口逆行情况。
除了扣分之外，逆行还可能面临罚款处罚。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。具体罚款数额可能因地区差异而有所调整。
因此，驾驶人在驾驶过程中应严格遵守交通规则，避免逆向行驶等违法行为，以确保道路交通安全。如果不慎在红绿灯路口站错道逆行，应及时纠正并接受相应的处罚。同时，也应加强交通安全意识的学习和培养，以避免类似情况的再次发生。