醉驾情节显著轻微危害不大不认为是犯罪的情况下，通常不会留下案底。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律依据与结论

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的规定，情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的，不追究刑事责任。这意味着，如果醉驾行为被认定为情节显著轻微且危害不大，那么就不会被视为犯罪，因此也就不会留下刑事案底。

二、具体情形与考量因素

在司法实践中，判断醉驾行为是否属于“情节显著轻微危害不大”，会综合考虑多种因素，包括但不限于：

• 醉酒程度：如血液中的酒精含量刚刚超过醉驾标准不多。
• 驾驶车辆类型：驾驶非营运车辆相较于驾驶特种车辆，对公共安全的潜在威胁较小。
• 行驶道路与速度：在偏远或交通流量少的道路上缓慢行驶，降低了发生严重事故的风险。
• 是否造成实际损害：未发生交通事故，未对他人造成损害。
• 认罪悔罪态度：被查获后能够如实供述罪行，积极配合调查处理。

三、司法实践中的处理

对于醉驾案件，司法机关会结合当地的交通状况、社会治安等实际情况，进行全面、客观的分析判断。只有在多种因素都表明醉驾行为对公共安全的危害确实非常小的情况下，才会作出不认为是犯罪的认定。

四、对“案底”的理解

通常所说的“案底”，是指一个人因为犯罪被司法机关记录在案的情况。既然醉驾行为在情节显著轻微且危害不大的情况下不被视为犯罪，那么自然也就不会留下所谓的“案底”。

综上所述，醉驾情节显著轻微危害不大不认为是犯罪的情况下，是不会留下案底的。但值得注意的是，即使不被视为犯罪，醉驾行为也是违法的，可能会受到行政处罚，如罚款、吊销驾驶证等。因此，建议广大驾驶员切勿酒后驾车，以免给自己和他人带来不必要的麻烦和危险。