当追尾事故中司机受伤时，赔偿流程涉及多个方面，以下为您提供详细解答：

一、确定事故责任

首先，需要由交警对事故进行责任认定。这是赔偿流程的基础，决定了各方应承担的责任比例。

• 若追尾方全责：追尾方需承担全部赔偿责任。
• 若双方都有责任：则按责任比例分担赔偿。

二、赔偿项目与计算

赔偿项目通常包括医疗费、误工费、护理费、交通费、营养费以及可能的残疾赔偿金、残疾辅助器具费等。

1. 医疗费：根据医院诊疗票据确定，包括治疗费、检查费、药费等。
2. 误工费：因受伤耽误工作而减少的收入，需提供误工证明和收入减少证明。
3. 护理费：依据护理的实际情况和相关标准计算，如护理人员收入、护理期限等。
4. 交通费：就医等产生的合理交通费用，应提供相应票据。
5. 营养费：根据医嘱确定是否需要及具体数额。
6. 残疾赔偿金、残疾辅助器具费：若造成伤残，还需赔偿残疾赔偿金和残疾辅助器具费。

三、赔偿顺序与方式

1. 交强险赔偿：先由对方车辆的交强险在限额内赔偿。
2. 商业险赔偿：超出交强险部分，由责任方的商业险按责任比例赔付。
3. 个人承担：若对方无商业险或商业险赔偿不足，则由对方车主自行承担。若司机自身有责任，在己方车辆保险范围内（如车上人员责任险）按相应比例获得赔偿。

四、协商与诉讼

双方可协商赔偿事宜，若协商不成，可通过诉讼解决。在诉讼过程中，法院将依据事故责任认定书、医疗票据、误工证明等证据，判决赔偿金额。

五、特殊情况的赔偿

• 若追尾导致流产：责任方还需赔偿因流产产生的检查费、治疗费、药费等实际支出，以及误工费、护理费、营养费、精神损害抚慰金等。
• 若车辆贬值：在某些特殊情况下（如新车或高档车辆），因追尾导致车辆贬值，可在合理范围内主张贬值损失赔偿，但需有专业评估证明贬值情况。

六、注意事项

1. 保留证据：司机应保留好相关票据、证明，以便准确计算赔偿金额并顺利获得赔偿。
2. 及时报警：发生事故后应及时报警并定责，以便后续赔偿流程顺利进行。
3. 了解法律：若涉及诉讼，建议了解相关法律法规，或咨询专业律师以维护自身合法权益。

综上所述，追尾司机受伤的赔偿流程涉及多个方面，包括确定事故责任、计算赔偿项目与金额、按照赔偿顺序与方式获得赔偿，以及可能的协商与诉讼。希望以上解答能对您有所帮助。