关于甲方扣除违约金是否需要开发票的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、违约金是否需要开票
甲方给的违约金不需要开具发票。原因如下：
未发生经营业务：根据《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第二十六条，填开发票的单位和个人必须在发生经营业务确认营业收入时开具发票。未发生经营业务一律不准开具发票。违约金并非因经营业务而产生，因此不需要开票。
违约金的性质：违约金被定性为一种价外费用，它并非商品或服务的交易对价，因此不属于发票的开具范围。同时，获得的违约金数额也不需要纳税。
二、合同违约赔偿的原则
在处理合同违约赔偿时，除了了解是否需要开票外，还应了解以下几个原则：
完全赔偿原则：违约方应赔偿因违约行为给受害人造成的全部损失，包括现实财产的减少和合同履行后可以获得的利益。
合理预见原则：赔偿损失不得超过违反合同一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违反合同可能造成的损失。
减轻损害原则：受害人必须采取合理措施以防止损害的扩大，否则违约方有权请求从损害赔偿金额中扣除本可避免的损害部分。
损益相抵原则：当受害人基于损害发生的同一原因而获得利益时，应将所受利益从所受损害中扣除，以确定损害赔偿范围。
三、总结
综上所述，甲方扣除违约金时不需要开具发票，因为违约金并非因经营业务而产生，且被定性为价外费用。在处理合同违约赔偿时，应遵循完全赔偿、合理预见、减轻损害和损益相抵等原则，以确保赔偿的公平性和合理性。