当过渡期限超过约定时间时，逾期临时安置补偿费和停产停业损失补偿费的计算标准如下：

一、逾期临时安置补偿费

对于选择房屋产权调换并自行安排住处的被征收人，若过渡期限超过约定时间，逾期临时安置补偿费的计算方式如下：

1. 逾期不足六个月的：

   • 逾期时间内临时安置补偿费按原约定标准的1.5倍发放。

2. 逾期半年以上不足一年的：

   • 本逾期时间内临时安置补偿费按原约定标准的2倍发放。

3. 逾期一年以上的：

   • 本逾期时间内临时安置补偿费按原约定标准的3倍发放。

若被征收人选择由房屋征收部门提供周转用房过渡，则从逾期之月起按月付给临时安置补助费；逾期一年以上的，临时安置补助费按规定标准的二倍发放，并且被征收人有权继续使用安置周转用房。

二、停产停业损失补偿费

对于因征收非住宅房屋造成的停产停业损失，若过渡期限超过约定时间，停产停业损失补偿费的计算方式如下：

1. 超过过渡期限一年以内的：

   • 本逾期时间内停产停业经济损失补助费按原约定标准的1.5倍发放。

2. 超过过渡期限一年以上的：

   • 本逾期时间内停产停业经济损失补助费按原约定标准的2倍发放。

三、执行要点与注意事项

1. 及时发放：补偿费应按月或按季度及时支付给被征收人，避免累积拖欠。

2. 动态调整：若市场租金水平或经营成本发生显著变化，双方可协商调整补偿标准。

3. 争议解决：对补偿金额有异议的，被征收人可通过行政复议或诉讼途径来维护自己的合法权益。

4. 保留证据：被征收人应妥善保留租赁合同、纳税证明等相关材料，以支持其索赔主张。

5. 签订书面协议：建议被征收人与征收部门签订书面协议，明确分段计算的具体细节，避免口头承诺可能引发的纠纷。

综上所述，逾期临时安置补偿费和停产停业损失补偿费的计算标准是根据过渡期限超过约定的时间长度来分段确定的，并且应确保及时、合理地支付给被征收人。