夫妻分开三年，对方的负债是否会有影响，这个问题主要取决于负债的性质以及负债是否用于夫妻共同生活或共同生产经营。

1. 如果负债是夫妻共同签名的，或者一方事后追认的，那么这笔负债就属于夫妻共同债务，无论夫妻是否分开，双方都需要承担。

2. 如果负债是夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义为家庭日常生活需要所负的，同样属于夫妻共同债务，双方也需要共同承担。

3. 然而，如果负债是夫妻一方在婚姻关系存续期间以个人名义超出家庭日常生活需要所负的，并且没有用于夫妻共同生活、共同生产经营，也没有基于夫妻双方共同意思表示，那么这笔负债就不属于夫妻共同债务，另一方原则上不需要承担。

因此，夫妻分开三年后，对方的负债是否会有影响，关键要看负债的具体性质和用途。如果你对此有疑问，或者需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的实际情况给出更详细的解答。