夜班16小时，只给13小时工资，其余3小时算睡岗，这种做法不合法。下面我详细为你解释：

首先，从劳动法的角度来看，劳动者的工作时间应当得到合理的计算和报酬。如果员工被安排夜班工作16小时，那么这16小时都应当被视为工作时间，并据此计算工资。将其中3小时算作“睡岗”而不支付工资，实际上是对劳动者工作时间的削减，这违反了劳动法的相关规定。

其次，即使某些行业或岗位存在特殊的工作安排，比如需要值班或待命，这也不能成为削减工作时间的理由。值班或待命时间同样应当被视为工作时间的一部分，并据此支付工资。

最后，如果用人单位坚持这种做法，劳动者可以向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径维护自己的合法权益。在维权过程中，劳动者可以收集相关证据，如工作记录、工资单等，以证明自己的工作时间和应得报酬。

综上所述，夜班16小时只给13小时工资，其余3小时算睡岗的做法是不合法的。劳动者应当了解自己的权益，并在必要时采取法律手段维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。