结论前置：司机因超载被扣6分，车主通常没有法定的补偿权利。

分析说明：

1. 交通法规角度：

   • 根据交通法规，司机超载是违法行为，需要承担相应的法律责任，包括罚款、扣分等。
   • 车主作为车辆的所有者，虽然对车辆有管理责任，但并不能因此获得因司机违法行为被处罚后的补偿。

2. 法律关系角度：

   • 车主与司机之间通常是雇佣或租赁等民事法律关系。在这些关系中，除非双方有明确的合同约定，否则车主没有权利要求司机因违法行为被扣分后给予补偿。
   • 即便双方有合同约定，该约定也不能违反法律法规的强制性规定，即不能约定因违法行为而产生的“补偿”。

3. 实际情况角度：

   • 在实际操作中，车主可能会因司机的违法行为而遭受一定的经济损失（如车辆被暂扣、罚款等），但这些损失通常应由司机承担，而不是由车主通过“补偿”的方式从司机那里获得。
   • 如果车主认为司机的违法行为给其造成了损失，可以通过民事诉讼等方式要求司机赔偿，但这与“补偿”不是同一概念。

总结：综上所述，司机因超载被扣6分是司机个人的违法行为所致，车主没有法定的补偿权利。车主应加强对司机的管理和教育，确保车辆安全、合法地行驶。如果车主因此遭受损失，应依法向司机追偿。