是否构成非法入侵民宅，需根据具体情况判断。
非法入侵民宅，即他人未经住宅主人许可或有权机关未依法定程序擅自侵入他人住宅的行为。这种行为触犯了《刑法》第二百四十五条的非法侵入住宅罪，可能会被判处三年以下有期徒刑或者拘役。
具体到你的情况，双方在其中一方门口发生冲突后，进入了其中一方的院子，这一行为是否构成非法入侵民宅，关键在于以下几点：
是否经过允许：如果进入院子的一方是得到了住宅主人的明确允许，或者是在紧急情况下为了避险等合理原因进入，那么就不构成非法入侵民宅。
冲突的性质：如果双方是在发生冲突的过程中，一方为了躲避伤害或者寻求帮助而进入另一方的院子，并且没有造成严重的后果，那么这种进入可能更多地被视为冲突中的避险行为，而非非法入侵。
进入后的行为：如果进入院子的一方在进入后没有实施任何进一步的不法行为，如破坏财物、伤害他人等，那么其行为的违法性可能会相对较低。
综上所述，要判断这一行为是否构成非法入侵民宅，需要综合考虑冲突的具体情况、进入的原因、进入后的行为以及是否得到了住宅主人的允许等因素。如果你对此仍有疑问，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。